RNA–Protein interactions for RNA: YKR018C

YKR018C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR018C, Length 2,178 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CYKR018C CUP2P15315 225 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C RPI1P23250 407 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C YBR184WP38299 523 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C CNL1Q06333 122 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C YOL029CQ08187 201 aa6.23□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C ADE8P04161 214 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C RPL30P14120 105 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C YGL015CP33199 130 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C DFG10P40526 253 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C YLR460CP54007 376 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C POL2P21951 2222 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C FLO9P39712 1322 aa6.22□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C SEC4P07560 215 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C SRP21P32342 167 aa6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C RML2P32611 393 aa6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C DER1P38307 211 aa6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C BAT1P38891 393 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C HAC1P41546 238 aa6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C LPP1Q04396 274 aa6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C TGS1Q12052 315 aa6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C SWT1Q12104 458 aa6.21□□□□□ -1.41
YKR018CYKR018C XPT1P47165 209 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C DSK2P48510 373 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C CPD1P53314 239 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C DIC1Q06143 298 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C FIT3Q08907 204 aa6.21□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C HMX1P32339 317 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C SHR5P41912 237 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YJR115WP47152 169 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C HNT2P49775 206 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C GRE1Q08969 168 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YAL064W-BO13512 126 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C MSI1P13712 422 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C SEC24P40482 926 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YIP5P53108 310 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C TNA1P53322 534 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YNR048WP53740 393 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YFH1Q07540 174 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C RKI1Q12189 258 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ATO3Q12359 275 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C POM34Q12445 299 aa6.2□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ARO2P28777 376 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C LSM2P38203 95 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C CYB5P40312 120 aa6.19□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C COQ5P49017 307 aa6.19□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C SLO1Q3E784 85 aa6.19□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YCR007CP25354 239 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C MSY1P48527 492 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YDL183CP48569 320 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YOR292CQ08743 309 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YER190C-BP0CX94 160 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YEL077W-AP0CX95 160 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YGR296C-BP0CX96 160 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YPL283W-BP0CX97 160 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YPR204C-AP0CX98 160 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C BEM2P39960 2167 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YNL198CP40166 100 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C PCL7P40186 285 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C MOB1P40484 314 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ADH6Q04894 360 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C MRL1Q06815 381 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YDL180WQ12301 547 aa6.18□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YUH1P35127 236 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C TDA4P47153 279 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ATG40Q99325 256 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ZRT1P32804 376 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C SHO1P40073 367 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YNL200CP40165 246 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C OYE3P41816 400 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ARP3P47117 449 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ABM1P47146 123 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C WSC2P53832 503 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C GRH1Q04410 372 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C RIM9Q04734 239 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C PAI3P01094 68 aa6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C QRI5P32344 111 aa6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C SRX1P36077 127 aa6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YKR070WP36151 352 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C UBS1P38290 277 aa6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C CCS1P40202 249 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YJR015WP47090 510 aa6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YNR061CP53747 219 aa6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data6.16□□□□□ -1.42not detected
YKR018CYKR018C MPD1Q12404 318 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C YLR302CO13544 120 aa6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C ATP10P18496 279 aa6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C RPS2P25443 254 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
YKR018CYKR018C MRP49P32388 137 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 114.3 ms