RNA–Protein interactions for RNA: YGR028W

MSP1, Transcript of Highly-conserved N-terminally anchored AAA-ATPase, yeast

Gene MSP1, Length 1,089 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSP1	YGR028W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	FEX1	Q08913	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	RDI1	Q12434	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	CAP2	P13517	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	ERV1	P27882	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	SPT14	P32363	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	HYM1	P32464	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
MSP1	YGR028W	RFC2	P40348	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YJR012C	P47087	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	CAB4	P53332	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	MSC3	Q05812	728 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	LAG1	P38703	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MSP1	YGR028W	CAX4	P53223	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	CPD1	P53314	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	DYN2	Q02647	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	QCR2	P07257	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	UTR5	P32630	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YAR068W	P39564	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	TPN1	P53099	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	ATG31	Q12421	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	AUA1	P32450	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	ERV15	P38312	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YGR219W	P53307	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	VPS28	Q02767	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	PEX10	Q05568	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	PHO92	Q06390	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	PAM18	Q07914	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	SPS2	P08459	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	PDC2	P32896	925 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	QDR3	P38227	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	AIM20	P40451	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	ERG25	P53045	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	NIF3	P53081	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	EST3	Q03096	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YNG1	Q08465	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	ECM27	P47144	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YGR050C	P53231	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YCT1	Q12235	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	MRS3	P10566	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	MRP17	P28778	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	SUA5	P32579	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	MIC12	P38341	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	WSS1	P38838	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YNL194C	P40169	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YKE4	P40544	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YGR210C	P42942	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YPI1	P43587	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YDR274C	P87283	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YLR302C	O13544	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YKL162C	P36052	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	MRPL3	P36516	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	SDH4	P37298	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YIR035C	P40579	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	COX2	P00410	251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	RRT1	P38192	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	YBR242W	P38331	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	DOG2	P38773	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	DOG1	P38774	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	MPC2	P38857	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	MST28	P39552	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	SIM1	P40472	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	MST27	P53176	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	RAD28	Q12021	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSP1	YGR028W	CYC3	P06182	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSP1	YGR028W	SEC22	P22214	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 204.8 ms