RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeastyeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSD1YGL196W AIF1P52923 378 aa3.22□□□□□ -1.89
DSD1YGL196W DML1Q03652 475 aa3.22□□□□□ -1.89
DSD1YGL196W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DSD1YGL196W VPS68Q12016 184 aa3.22□□□□□ -1.89
DSD1YGL196W RPC19P28000 142 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W MEI4P29467 408 aa3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W CPR5P35176 225 aa3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YKR041WP36134 250 aa3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W MRPL17P36528 281 aa3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W RBL2P48606 106 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W SLM2P53955 656 aa3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W DYN3Q04949 312 aa3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W TIM9O74700 87 aa3.2□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YHR180WP38868 163 aa3.2□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W ICE2P40499 491 aa3.2□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YFH7P43591 353 aa3.2□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W ARP3P47117 449 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YGR219WP53307 113 aa3.2□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W SUE1Q06524 206 aa3.2□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W HSP30P25619 332 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W AHC2P25649 128 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W ARO7P32178 256 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data3.19□□□□□ -1.9not detected
DSD1YGL196W FMP23P38231 175 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W UMP1P38293 148 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W LSM4P40070 187 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W PGD1P40356 397 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W ARO8P53090 500 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YKR005CQ02203 525 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W HRT1Q08273 121 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W DAS2Q12084 232 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W EMC6Q12431 108 aa3.19□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W ATP15P21306 62 aa3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W NVJ1P38881 321 aa3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W AIM2P39721 246 aa3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YER121WP40076 114 aa3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W GVP36P40531 326 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W PGA1P53896 198 aa3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W DAD3P69850 94 aa3.18□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W OCH1P31755 480 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W SNC2P33328 115 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W POP7P38291 140 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W GAA1P39012 614 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W FCY21P40039 528 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W TDA4P47153 279 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W AIM34Q03673 198 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W ATO3Q12359 275 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YRF1-3P0CX14 1859 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YRF1-7P0CX15 1859 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YRF1-6P53819 1859 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W RIM15P43565 1770 aa3.17□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W CCH1P50077 2039 aa3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W QCR2P07257 368 aa3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YER076CP40049 302 aa3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W DOC1P53068 250 aa3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W SPC2Q04969 178 aa3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W SHH4Q06236 168 aa3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W DGA1Q08650 418 aa3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YPR014CQ6B0W2 109 aa3.16□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W FLO1P32768 1537 aa3.15□□□□□ -1.9
DSD1YGL196W YOR062CP36025 268 aa3.15□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W VMA10P48836 114 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W YNR062CP53748 327 aa3.15□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W NUP49Q02199 472 aa3.15□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W ODC2Q99297 307 aa3.15□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W FIG2P25653 1609 aa3.15□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W UTR5P32630 166 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W AME1P38313 324 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W YBR285WP38354 144 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W VMA22P38784 181 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W AGE2P40529 298 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W YKE4P40544 346 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W SER2P42941 309 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W CIS3P47001 227 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W MRPS8Q03799 155 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W SPC24Q04477 213 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W YLR053CQ12026 108 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W OCA6Q12454 224 aa3.14□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W PEX4P29340 183 aa3.13□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W YBL010CP32788 280 aa3.13□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91not detected
DSD1YGL196W TVP38P36164 337 aa3.13□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W ERV15P38312 142 aa3.13□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W YEA4P40004 342 aa3.13□□□□□ -1.91
DSD1YGL196W YER134CP40081 178 aa3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.2 ms