RNA–Protein interactions for RNA: YEL065W

SIT1, Transcript of Ferrioxamine B transporter, yeast

Gene SIT1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIT1	YEL065W	RPB5	P20434	215 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	ERG2	P32352	222 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	PTC1	P35182	281 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YIL024C	P40543	189 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	RPR2	P40571	144 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	COS10	P52924	374 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	ATX2	Q12067	313 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SIT1	YEL065W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	PRM5	P40476	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SNM1	P40993	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	MIC19	P43594	170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	TDA4	P47153	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	AIF1	P52923	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SFT1	P43682	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SPC3	Q12133	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SPT14	P32363	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YER181C	P40097	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SNO3	P43544	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	ATG18	P43601	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	CRH1	P53301	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	APJ1	P53940	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	AIM11	P87275	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	FMP42	Q04991	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	ZRT3	P34240	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YHR140W	P38842	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YGL262W	P53054	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	ATP5	P09457	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SRP21	P32342	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	MSA2	P36157	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	CHS7	P38843	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	AVT6	P40074	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	STB1	P42845	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	GPI2	P46961	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YJL028W	P47062	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	CRC1	Q12289	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	VAR1	P02381	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	MOB1	P40484	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SUN4	P53616	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	WSC2	P53832	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YNL033W	P53964	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YNL019C	P53975	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	VPS28	Q02767	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YLR462W	O13556	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	RNQ1	P25367	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YOR062C	P36025	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SIT1	YEL065W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YEL075C	P39972	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	ATG5	Q12380	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	CSE2	P33308	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	NSG1	P38837	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	HAP2	P06774	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SPS2	P08459	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	DAD3	P69850	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	SNF2	P22082	1703 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIT1	YEL065W	AVT2	P39981	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIT1	YEL065W	PGU1	P47180	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIT1	YEL065W	SCW10	Q04951	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIT1	YEL065W	MCP1	Q12106	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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