RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT1	YBL048W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.49	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.49	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	STF2	P16965	84 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	YCR023C	P25351	611 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	STP22	P25604	385 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	SHG1	P38337	142 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	SBH1	P52870	82 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	HOP2	P53187	214 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	PGA1	P53896	198 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	NRK1	P53915	240 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	PIR1	Q03178	341 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	ATP20	Q12233	115 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.48	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.47	□□□□□ -2.33	not detected
RRT1	YBL048W	SEN2	P16658	377 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	YKR041W	P36134	250 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	RRT1	P38192	103 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	MET31	Q03081	177 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	SNO1	Q03144	224 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	GAL83	Q04739	417 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	UPS1	Q05776	175 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	SHH4	Q06236	168 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	DAS2	Q12084	232 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	DGK1	Q12382	290 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.47	□□□□□ -2.33
RRT1	YBL048W	AHC2	P25649	128 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YBL010C	P32788	280 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YKL102C	P34249	101 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	MRPL15	P36523	253 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	NVJ1	P38881	321 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	MPM1	P40364	252 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	NSE4	P43124	402 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	FMP32	P43557	207 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	SBH2	P52871	88 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YGL235W	P53071	178 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	DML1	Q03652	475 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	GPI17	Q04080	534 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	ELP6	Q04868	273 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	GRE1	Q08969	168 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	UBC8	P28263	218 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	AHT1	P29589	182 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	CPR5	P35176	225 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	CLG1	P35190	452 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YBR242W	P38331	238 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	RFC2	P40348	353 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	GIM3	P53900	129 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	VPS28	Q02767	242 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	AIM36	Q03798	255 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YHP1	Q04116	353 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YET3	Q07451	203 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	ATG41	Q12048	136 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	HSP30	P25619	332 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	ATP7	P30902	174 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	ETR1	P38071	380 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YFL051C	P43552	160 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	SOL1	P50278	321 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	HHT1	P61830	136 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	GRX5	Q02784	150 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	FIT1	Q04433	528 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	RIM9	Q04734	239 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	LCL2	Q08045	131 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	RIF1	P29539	1916 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	MAK31	P23059	88 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YHL037C	P38733	133 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	POG1	P40473	351 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	TTI2	P47168	421 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	PEX11	Q12462	236 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	RAD6	P06104	172 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.42	□□□□□ -2.34	not detected
RRT1	YBL048W	YAR064W	P39563	99 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	MOB1	P40484	314 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	JAC1	P53193	184 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	TIM13	P53299	105 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	TRM3	Q07527	1436 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	SRP14	P38985	146 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YIL102C	P40488	101 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
RRT1	YBL048W	YIP3	P53633	176 aa		0.41	□□□□□ -2.34

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