RNA–Protein interactions for RNA: YAL018C

LDS1, Transcript of Protein Involved in spore wall assembly, yeast

Gene LDS1, Length 978 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LDS1	YAL018C	YER188W	P40103	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	HCH1	P53834	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	RKI1	Q12189	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	PRR2	Q12310	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	JID1	Q12350	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	QCR9	P22289	66 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	SIP1	P32578	815 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	YKL075C	P36083	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	HXT14	P42833	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	YJL163C	P46996	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	YGR151C	P53287	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	CAF40	P53829	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	MRS4	P23500	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	DFG10	P40526	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	CAF16	P43569	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	YNL234W	P53857	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	DYN2	Q02647	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	SRL1	Q08673	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	YCR025C	P25352	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	MSK1	P32048	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	YBL071C	P38185	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	WSS1	P38838	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	LST8	P41318	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	BOR1	P53838	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	ORM2	Q06144	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	TMA10	Q06177	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	FCY1	Q12178	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LDS1	YAL018C	CCW14	O13547	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	LDS1	P31379	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SRB6	P32570	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YKR045C	P36138	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SIT1	P39980	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YGR269W	P40326	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SAS2	P40963	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SNN1	P48232	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	MIC27	P50945	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	CRH1	P53301	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	ODC1	Q03028	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	ADD37	Q03233	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	TMA23	Q03525	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	MCH1	Q07376	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	NDE2	Q07500	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	ATP14	Q12349	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	COX19	Q3E731	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	AHT1	P29589	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	DAL3	P32459	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	QDR3	P38227	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	CSH1	P38287	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	DOG2	P38773	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	DOG1	P38774	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YJR015W	P47090	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	MRS3	P10566	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SPO13	P23624	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	RIB5	P38145	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	AVT5	P38176	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	CDS1	P38221	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YAR068W	P39564	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YJL213W	P40896	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SDH7	Q04401	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	POS5	Q06892	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	BPH1	P25356	2167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	CDC50	P25656	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	YBL059W	P34224	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	RRT1	P38192	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	ATC1	Q04005	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SPG4	Q04438	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SHH3	Q04487	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	ARR3	Q06598	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	USV1	Q12132	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	POM34	Q12445	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	INO2	P26798	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	DER1	P38307	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	BDH1	P39714	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	PAU4	P53427	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	FLO5	P38894	1075 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	MCM22	P47167	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDS1	YAL018C	LST7	P53237	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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