RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RTS2	P40962	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YJR012C	P47087	207 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	APJ1	P53940	528 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	MHR1	Q06630	226 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	DCN1	Q12395	269 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	COX19	Q3E731	98 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AMD1	YML035C	YHL044W	P38727	235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SEN15	Q04675	128 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	RIM9	Q04734	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	RFM1	Q12192	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	ATP10	P18496	279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	LSB5	P25369	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	POF1	P25576	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	TCA17	P32613	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	ERV15	P38312	142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	DAN1	P47178	298 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SPO13	P23624	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SPS18	P32572	300 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	GPI18	P38211	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	CTR2	P38865	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YIL012W	P40551	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	PIR5	P46999	287 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YNR064C	P53750	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YFH1	Q07540	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SOR2	Q07786	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SWT1	Q12104	458 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	ATG5	Q12380	294 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SSS1	P35179	80 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YBR013C	P38215	129 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	NCA3	P46955	337 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	TTI2	P47168	421 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	TMA23	Q03525	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	HOF1	Q05080	669 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	TRA1	P38811	3744 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SCM4	P32564	187 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	IES6	P32617	166 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	GET2	P40056	285 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	POG1	P40473	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YIR020C	P40575	100 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	HED1	Q03937	162 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	HRD1	Q08109	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YMR31	P19955	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SDH4	P37298	181 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YEA4	P40004	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	AGC1	Q12482	902 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	ROX3	P25046	220 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YCR025C	P25352	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	CDC50	P25656	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	REC104	P33323	182 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	AIM24	P47127	394 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	FSH2	Q05015	223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	USV1	Q12132	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	PCL7	P40186	285 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YJL118W	P47022	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	BNS1	P50084	137 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YGL262W	P53054	175 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YGL114W	P53134	725 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	ERV14	P53173	138 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	LPP1	Q04396	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	UPS2	P35200	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	HXT14	P42833	540 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	PAM18	Q07914	168 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	ABM1	P47146	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	TIM21	P53220	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YNR066C	P53752	436 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	OCA2	P53949	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AMD1	YML035C	YPD1	Q07688	167 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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