RNA–Protein interactions for RNA: YGR028W

MSP1, Transcript of Highly-conserved N-terminally anchored AAA-ATPase, yeast

Gene MSP1, Length 1,089 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSP1	YGR028W	YHR122W	P38829	231 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	HPA3	P39979	161 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	FCY21	P40039	528 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	BMT5	P40493	336 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	VPS55	P47111	140 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	CRH1	P53301	507 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	SPO19	Q03029	223 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	HOR7	Q05827	59 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	NDE2	Q07500	545 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	YOR292C	Q08743	309 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	MED4	Q12343	284 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSP1	YGR028W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YKR045C	P36138	183 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	PRM5	P40476	318 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	UBP8	P50102	471 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	MRPL13	Q02204	264 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	MSH5	Q12175	901 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	ROX3	P25046	220 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	FMT1	P32785	401 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YJL213W	P40896	331 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	SPS18	P32572	300 aa		5	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	IRC18	P47056	224 aa		5	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	TOS8	P53147	276 aa		5	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	RSM27	P53305	110 aa		5	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YMR181C	Q03231	154 aa		5	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	PET20	Q99373	253 aa		5	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	ELO2	P25358	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YKL075C	P36083	450 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	MBA1	P38300	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	COS8	P38723	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	FLO5	P38894	1075 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	POP2	P39008	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	SER2	P42941	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	CAB5	Q03941	241 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	IRC23	Q08416	157 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	STF2	P16965	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YMR31	P19955	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	POP8	P38208	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	IES5	P40060	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	MEH1	Q02205	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	VBA1	Q04301	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	SYM1	Q06563	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	YPS1	P32329	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	SYG1	P40528	902 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	AIM25	P47140	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	GIM3	P53900	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	SCP1	Q08873	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSP1	YGR028W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YBR144C	P34215	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	SRY1	P36007	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	GEP4	P38812	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	THI74	Q04083	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	FMP42	Q04991	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	SEC66	P33754	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	COX15	P40086	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	FSH2	Q05015	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	RTT103	Q05543	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	HRD1	Q08109	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	PRM3	Q08931	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	FEX2	Q08991	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	ATG5	Q12380	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	PRM4	Q12498	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	VPS63	O13549	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	CPR4	P25334	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	DFG10	P40526	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	LST8	P41318	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	YHP1	Q04116	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	POS5	Q06892	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSP1	YGR028W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.2 ms