RNA–Protein interactions for RNA: YFR004W

RPN11, Transcript of Metalloprotease subunit of 19S regulatory particle, yeast

Gene RPN11, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPN11	YFR004W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	RFU1	Q08003	200 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	YOL118C	Q08259	102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	SWT1	Q12104	458 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	FRE8	Q12209	686 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	AGC1	Q12482	902 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPN11	YFR004W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YLR302C	O13544	120 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	MSI1	P13712	422 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	APA2	P22108	325 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YCR101C	P25607	182 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	MRPS5	P33759	307 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	SLM6	P38343	150 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	FLX1	P40464	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YFL051C	P43552	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YNR066C	P53752	436 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	RAF1	Q06891	181 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YPD1	Q07688	167 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	RAD28	Q12021	506 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YDL180W	Q12301	547 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	ATG5	Q12380	294 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	IZH2	Q12442	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	SPS4	P09937	338 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YCR025C	P25352	136 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	IMP1	P28627	190 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YKL187C	P34231	750 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	MRPL4	P36517	319 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YBR096W	P38256	230 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YIL029C	P40538	142 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	DAN1	P47178	298 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	TIM21	P53220	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YAP6	Q03935	383 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	FSH2	Q05015	223 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	DGK1	Q12382	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	SPO24	Q3E752	67 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	ATG40	Q99325	256 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	SPO13	P23624	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	ERV1	P27882	189 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	LAC1	P28496	418 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	CLB6	P32943	380 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	UPS2	P35200	230 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	MRPL39	P36533	70 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	SDH4	P37298	181 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YBR292C	P38357	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	MTC6	P38849	526 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YIL012W	P40551	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	TAX4	P47030	604 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YFH1	Q07540	174 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	FCY22	Q12119	530 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	PRR2	Q12310	699 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	LAS17	Q12446	633 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	POF1	P25576	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	CDC50	P25656	391 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YBR013C	P38215	129 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	PCL7	P40186	285 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	RTS2	P40962	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	HXT14	P42833	540 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YGL262W	P53054	175 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	CGR1	P53188	120 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	FYV6	P53913	173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YPL077C	Q02831	240 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	RIM9	Q04734	239 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YMR254C	Q04838	102 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	PIN3	Q06449	215 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	GEP5	Q12393	293 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	POP5	P28005	173 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YUH1	P35127	236 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	SLM1	P40485	686 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	XPT1	P47165	209 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	BNS1	P50084	137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	ERG25	P53045	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	GEP7	P53171	287 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	RCE1	Q03530	315 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YPR098C	Q06089	161 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	RXT3	Q07458	294 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	PAM18	Q07914	168 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	IZH3	Q07959	543 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YOL029C	Q08187	201 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YOR292C	Q08743	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	YPL264C	Q08980	353 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPN11	YFR004W	USV1	Q12132	391 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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