RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 IL18RAPO95256 599 aa25.44■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 GJB6O95452 261 aa25.44■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 RALAP11233 206 aa25.44■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 CCT5P48643 541 aa25.44■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.44■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 SHBGP04278 402 aa25.43■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.43■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.43■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.43■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 ASIC3Q9UHC3 531 aa25.43■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 PLXNB2O15031 1838 aa25.43■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 WEE2P0C1S8 567 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 CXCL8P10145 99 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 IGBP1P78318 339 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 LGALS2P05162 132 aa25.42■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 PPP2R2AP63151 447 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 LAMC2Q13753 1193 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 PTGISQ16647 500 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC114Q96M63 670 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 HEMGNQ9BXL5 484 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 OSBPL8Q9BZF1 889 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 EPN3Q9H201 632 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.42■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa25.42■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 PCDHGC3Q9UN70 934 aa25.42■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 TMEM191CA6NGB0 347 aa25.41■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 TLCD1Q96CP7 247 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 SNF8Q96H20 258 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 CEP83Q9Y592 693 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 NDUFAB1O14561 156 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 INSRRP14616 1297 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 FGFR4P22455 802 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 CCNA1P78396 465 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 SLC29A2Q14542 456 aa25.41■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 MCEEQ96PE7 176 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.41■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 IQCF3P0C7M6 154 aa25.4■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM192Q8IY95 271 aa25.4■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.4■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 ATL2Q8NHH9 583 aa25.4■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 POLIQ9UNA4 740 aa25.4■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.39■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 RIPK2O43353 540 aa25.39■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa25.39■■□□□ 1.66
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TRIM54-201ENST00000296098 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.39■■□□□ 1.66
TRIM54-201ENST00000296098 VTA1Q9NP79 307 aa25.39■■□□□ 1.66
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