RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	SNC2	P33328	115 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YRB2	P40517	327 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YDR274C	P87283	123 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ABF2	Q02486	183 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	GIS3	Q12418	502 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RSF2	P46974	1380 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CBF1	P17106	351 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YCL042W	P25572	119 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YLR162W	Q06235	118 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TSC3	Q3E790	80 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	DDI2	P0CH63	225 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	DDI3	P0CH64	225 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	STE18	P18852	110 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	APS1	P35181	156 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ICE2	P40499	491 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.18	□□□□□ -2.38	not detected
HAL9	YOL089C	BNA7	Q04066	261 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YOL160W	Q08321	113 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RAD28	Q12021	506 aa		0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TFC1	P32367	649 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	SRY1	P36007	326 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TRM5	P38793	499 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	PEX17	P40155	199 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	REP2	P03872	296 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	COQ1	P18900	473 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	GAA1	P39012	614 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YPL073C	P40323	161 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	HOC1	P47124	396 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	AIM25	P47140	327 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	PRM8	P53174	237 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	HHT1	P61830	136 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RCE1	Q03530	315 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ANT1	Q06497	328 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YOL014W	Q08110	124 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TPO4	Q12256	659 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YDL180W	Q12301	547 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	GCN3	P14741	305 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	BET1	P22804	142 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YBR209W	P38311	105 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	SBH1	P52870	82 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	GET1	P53192	235 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ARR2	Q06597	130 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CSM4	Q08955	156 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	SEY1	Q99287	776 aa		0.17	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	KNH1	P50112	268 aa		0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	FUS2	Q05670	677 aa		0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ATG40	Q99325	256 aa		0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	KSS1	P14681	368 aa		0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	MRPL17	P36528	281 aa		0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	KRE28	Q04431	385 aa		0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.15	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	EHD3	P28817	500 aa		0.15	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CTR2	P38865	189 aa		0.15	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	BOL2	P53082	120 aa		0.15	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.15	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	UMP1	P38293	148 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	RAD17	P48581	401 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	SWP1	Q02795	286 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	IGO2	Q9P305	131 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	TAO3	P40468	2376 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	ERD2	P18414	219 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	TRX3	P25372	127 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	AHT1	P29589	182 aa		0.15	□□□□□ -2.39
HAL9	YOL089C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39

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