RNA–Protein interactions for RNA: YML061C

PIF1, Transcript of DNA helicase, potent G-quadruplex DNA binder/unwinder, yeast

Gene PIF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIF1	YML061C	AAH1	P53909	347 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PPZ2	P33329	710 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	UTH1	P36135	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	AVT7	P40501	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YFL054C	P43549	646 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PHO23	P50947	330 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CWC27	Q02770	301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	HRD1	Q08109	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	BMT5	P40493	336 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	NAM2	P11325	894 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MDH2	P22133	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	FMT1	P32785	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	IKI1	P38874	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ATG21	Q02887	496 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MDM30	Q05930	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SPS4	P09937	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MNS1	P32906	549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SRP14	P38985	146 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YDL186W	P48568	277 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YGR026W	P53217	278 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ODC1	Q03028	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	NUD1	P32336	851 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SBH2	P52871	88 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	OCA2	P53949	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MCH4	Q08268	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MSW1	P04803	379 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	REE1	P40893	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RPA43	P46669	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	AIM24	P47127	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	NRM1	P53718	249 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	EST3	Q03096	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	LDS2	Q08218	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MCT1	Q12283	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PRM4	Q12498	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	HUT1	Q12520	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PMT2	P31382	759 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SRB6	P32570	121 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MRPL15	P36523	253 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ECM31	P38122	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YHL044W	P38727	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YND1	P40009	630 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MGA1	P53050	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	NCE103	P53615	221 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
PIF1	YML061C	RRI1	Q12468	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YKL187C	P34231	750 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	NSE4	P43124	402 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	VPS28	Q02767	242 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	TRS23	Q03784	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SYM1	Q06563	197 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CUP9	P41817	306 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	IDP2	P41939	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	TAX4	P47030	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RSM23	Q01163	450 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SRL2	Q12020	392 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YCR023C	P25351	611 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	PGU1	P47180	361 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	NRK1	P53915	240 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ADD37	Q03233	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	NUP53	Q03790	475 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SCO1	P23833	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	BUL1	P48524	976 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	COX18	P53239	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	MTM1	P53320	366 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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