RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	UBC12	P52491	188 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	YGR219W	P53307	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	NRK1	P53915	240 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	GIM5	Q04493	163 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	CDC25	P04821	1589 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	IRC20	Q06554	1556 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	ATG2	P53855	1592 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	SNF6	P18888	332 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	VPS51	P36116	164 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	GLE2	P40066	365 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	DNF1	P32660	1571 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	SNF4	P12904	322 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	MRPL17	P36528	281 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	PGD1	P40356	397 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	ICE2	P40499	491 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	SNO1	Q03144	224 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	ATO3	Q12359	275 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPS31	YLR167W	LTE1	P07866	1435 aa		3.09	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	MMS1	Q06211	1407 aa		3.09	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	TIM9	O74700	87 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	MRPS28	P21771	286 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	UMP1	P38293	148 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YNR062C	P53748	327 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	FUS2	Q05670	677 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	ATP15	P21306	62 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	PEX4	P29340	183 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	DOC1	P53068	250 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	JAC1	P53193	184 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	GRX8	Q05926	109 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.07	□□□□□ -1.92	not detected
RPS31	YLR167W	GRE1	Q08969	168 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
RPS31	YLR167W	ECM4	P36156	370 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YKE4	P40544	346 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	CIS3	P47001	227 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	SSK2	P53599	1579 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YIP3	P53633	176 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	MET5	P47169	1442 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	MGT1	P26188	188 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	OCH1	P31755	480 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	SNC2	P33328	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	FMP23	P38231	175 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	ERV15	P38312	142 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YLR460C	P54007	376 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	CLG1	P35190	452 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	SVP26	P38869	228 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	FMP32	P43557	207 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	RGM1	Q00453	211 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YKR041W	P36134	250 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	SRP14	P38985	146 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YNL140C	P53910	189 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RPS31	YLR167W	RPO31	P04051	1460 aa		3.03	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	DNF2	Q12675	1612 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	TRX3	P25372	127 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	RAD51	P25454	400 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YBR285W	P38354	144 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	TIR3	P40552	269 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	ODC2	Q99297	307 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	ARO7	P32178	256 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	YET1	P35723	206 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPS31	YLR167W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
RPS31	YLR167W	TDA4	P47153	279 aa		3.01	□□□□□ -1.93

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