RNA–Protein interactions for RNA: YBL099W

ATP1, Transcript of Alpha subunit of the F1 sector of mitochondrial F1F0 ATP synthase, yeast

Gene ATP1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATP1	YBL099W	TMA17	Q12513	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATP1	YBL099W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PDX1	P16451	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	MDH2	P22133	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PEX4	P29340	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	RPB7	P34087	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YBR096W	P38256	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU13	P38725	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	REE1	P40893	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	HHT1	P61830	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU10	Q03050	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU20	Q08322	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PRR2	Q12310	699 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	COA6	Q3E846	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	BLM10	P43583	2143 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	SPS4	P09937	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	SPO13	P23624	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YCR025C	P25352	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ERV1	P27882	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YHR210C	P38893	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	HSP10	P38910	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	CUP9	P41817	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	HED1	Q03937	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	DAP1	Q12091	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	RIP1	P08067	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	CDC26	P14724	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU3	P25610	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YUH1	P35127	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	SOH1	P38633	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PTC7	P38797	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	MSY1	P48527	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PDR17	P53844	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	GIS1	Q03833	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	GRE1	Q08969	168 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	FRE8	Q12209	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	IRC22	P40006	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PAU5	P43575	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	PGU1	P47180	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	OST3	P48439	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	HNT2	P49775	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YDC1	Q02896	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ATC1	Q04005	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	THI72	Q08579	599 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ATG15	P25641	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	AHT1	P29589	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	SWD3	P38123	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YNL165W	P53891	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	STD1	Q02794	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	SDC1	Q03323	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	TRS23	Q03784	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YFH1	Q07540	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	RFU1	Q08003	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ERV2	Q12284	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ATP5	P09457	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	COQ3	P27680	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	UIP3	P39547	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ATG27	P46989	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YGR149W	P48236	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	MIX14	Q04341	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	NDE2	Q07500	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	FYV7	Q12247	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	ATG5	Q12380	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	YOP1	Q12402	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP1	YBL099W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37 ms