RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRAMEF12O95522 483 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM193AP78312 1265 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IQCEQ6IPM2 695 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PIP4P1Q86T03 277 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CAMKK1Q8N5S9 505 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GPR88Q9GZN0 384 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GDAQ9Y2T3 454 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RNF40O75150 1001 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RHOBTB1O94844 696 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLITRK3O94933 977 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EGFP01133 1207 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CPA1P15085 419 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ELF2Q15723 593 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM187BQ17R55 369 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TPGS2Q68CL5 300 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PMS2CLQ68D20 193 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GAREM2Q75VX8 874 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LEMD2Q8NC56 503 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PCDH15Q96QU1 1955 aa18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 A0A087WWV3 80 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BCKDHBP21953 392 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 INF2Q27J81 1249 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HPS4Q9NQG7 708 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.59■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TRAPPC3O43617 180 aa18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NLRP5P59047 1200 aa18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SCAPQ12770 1279 aa18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ELMOD1Q8N336 334 aa18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM20AQ96MK3 541 aa18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EBF1Q9UH73 591 aa18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 YIPF1Q9Y548 306 aa18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HELZP42694 1942 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 N4BP3O15049 544 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ATG13O75143 517 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DGAT1O75907 488 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AAMPQ13685 434 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TPH2Q8IWU9 490 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BEST2Q8NFU1 509 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BSNDQ8WZ55 320 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UROC1Q96N76 676 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.57■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SYN3O14994 580 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RARRES1P49788 294 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SEMA3BQ13214 749 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ALKAL1Q6UXT8 129 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BLIDQ8IZY5 108 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TMEM130Q8N3G9 435 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DAGLBQ8NCG7 672 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HSD17B14Q9BPX1 270 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM83CQ9BQN1 747 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 OBP2AQ9NY56 170 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ANTXRLA6NF34 631 aa18.55■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PODXLO00592 558 aa18.55■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LYPLA2O95372 231 aa18.55■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IFNAR1P17181 557 aa18.55■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GBP1P32455 592 aa18.55■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.4 ms