RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR278CQ05854 1341 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS4P52917 437 aa3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P DUS1P53759 423 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P GRX6Q12438 231 aa3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P AFG2P32794 780 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P PNT1P38969 423 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P MPP10P47083 593 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P UBP16Q02863 499 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P THI22Q06490 572 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P GAS5Q08193 484 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P TPD3P31383 635 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P GLC3P32775 704 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P TIF4632P39936 914 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P MAM1P40065 302 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SET4P42948 560 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P GYP7P48365 746 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P RTT109Q07794 436 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P RIM15P43565 1770 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P TRP5P00931 707 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P KRE2P27809 442 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P NGR1P32831 672 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP133P36161 1157 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P STV1P37296 890 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P PEA2P40091 420 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P YIL089WP40500 205 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR117CP53270 476 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR122WP53272 402 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P TIM50Q02776 476 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P CWC15Q03772 175 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL057WQ08225 711 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P CBP1P07252 654 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SWC3P31376 625 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P MGM1P32266 881 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P ICP55P40051 511 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P EMP47P43555 445 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P ITC1P53125 1264 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P DNM1P54861 757 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR271WQ06152 274 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P TOS4Q06266 489 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL144CQ07589 356 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P PSH1Q12161 406 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P DPH6Q12429 685 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SWI1P09547 1314 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SDH2P21801 266 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P ETP1P38748 585 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SPL2P38839 148 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P CST6P40535 587 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P HXT10P43581 546 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SRT1Q03175 343 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P CRF1Q04930 467 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P THI3Q07471 609 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P MRP7P12687 371 aa3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P PAM1P37304 830 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC4Q03036 179 aa3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SRC1Q03707 834 aa3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P TIF6Q12522 245 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P PMD1P32634 1753 aa3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX29Q03370 554 aa3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR306CQ06640 478 aa3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P CSR2Q12734 1121 aa3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD24P32641 659 aa3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P SLA1P32790 1244 aa3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data3.27□□□□□ -1.89not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P UBP12P39538 1254 aa3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P JJJ2P46997 583 aa3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P HVG1P0CE11 249 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P SPT21P35209 758 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P MTC3P53077 123 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P JIP4Q03361 876 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P PIB1Q06651 286 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P FLO11P08640 1367 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P ARG82P07250 355 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P MAC1P35192 417 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P APE3P37302 537 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P BSD2P38356 321 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P SET1P38827 1080 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P NIT1P40447 199 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P YIR042CP40586 236 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR008WP47085 338 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P NCS6P53088 359 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P RRT6P53117 311 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P PUS6P53294 404 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.4 ms