RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C TFB3Q03290 321 aa3.21□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C YNL108CP53929 270 aa3.2□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C YTA6P40328 754 aa3.2□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C STB3Q12427 513 aa3.2□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C MRPL16P38064 232 aa3.19□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C RPN1P38764 993 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C MSN5P52918 1224 aa3.19□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C YPP1P46951 817 aa3.18□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C HDA3Q06623 655 aa3.18□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C SYT1Q06836 1226 aa3.18□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C IRE1P32361 1115 aa3.18□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C YJL007CP47080 104 aa3.18□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C SSN3P39073 555 aa3.17□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C SUM1P46676 1062 aa3.17□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C CCT8P47079 568 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C PKC1P24583 1151 aa3.17□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C MET1P36150 593 aa3.17□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C TAT1P38085 619 aa3.17□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C HAL5P38970 855 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C SPT2P06843 333 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data3.16□□□□□ -1.9not detected
HAL9YOL089C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data3.16□□□□□ -1.9not detected
HAL9YOL089C JJJ2P46997 583 aa3.16□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C TY1A-DR3Q12441 440 aa3.16□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C YFL066CP43538 392 aa3.16□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.16□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C MAC1P35192 417 aa3.15□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C SLA1P32790 1244 aa3.14□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C KTR7P40504 517 aa3.14□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C GPM1P00950 247 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C SLX8P40072 274 aa3.13□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C BIO2P32451 375 aa3.13□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C AIM9P40053 627 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C HPC2Q01448 625 aa3.13□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C ENO2P00925 437 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C PDI1P17967 522 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C PDC6P26263 563 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C YFL034WP43564 1073 aa3.12□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C SWI5P08153 709 aa3.12□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C MCA1Q08601 432 aa3.12□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C LEU3P08638 886 aa3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C HGH1P48362 394 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C PSH1Q12161 406 aa3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C NTH2P35172 780 aa3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C PRY1P47032 299 aa3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C MTO1P53070 669 aa3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C Q0182Q9ZZW1 134 aa3.1□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C PDC5P16467 563 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C ALG14P38242 237 aa3.09□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C LSB6P42951 607 aa3.09□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
HAL9YOL089C RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C APL6P46682 809 aa3.08□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C SKN7P38889 622 aa3.08□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C AMN1P38285 549 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C YDR215CQ12240 137 aa3.07□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C YCK2P23292 546 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C MLF3P32047 452 aa3.06□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C NHA1Q99271 985 aa3.06□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C CYT1P07143 309 aa3.06□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C SUP45P12385 437 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C OMA1P36163 345 aa3.06□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C NCL1P38205 684 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C ENO1P00924 437 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C RGP1P16664 663 aa3.05□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C BIM1P40013 344 aa3.05□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C COQ2P32378 372 aa3.05□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C SPR3P41901 512 aa3.05□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C RIM21P48565 533 aa3.05□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C TSC13Q99190 310 aa3.04□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C PGM2P37012 569 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C YNL165WP53891 406 aa3.04□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C YPL034WQ03083 165 aa3.04□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C ATG32P40458 529 aa3.04□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C LEU1P07264 779 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C TIF1P10081 395 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
HAL9YOL089C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C RPS31P05759 152 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C YPQ2Q06328 317 aa3.01□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C LIP5P32875 414 aa3.01□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C RRM3P38766 723 aa3.01□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C CWH41P53008 833 aa3.01□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C HEH2Q03281 663 aa3.01□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C GAS5Q08193 484 aa3.01□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C ALD2P47771 506 aa3.01□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C RDS2P19541 446 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C FOX2Q02207 900 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C MCM1P11746 286 aa3□□□□□ -1.93
HAL9YOL089C KAP122P32767 1081 aa3□□□□□ -1.93
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