RNA–Protein interactions for RNA: YMR271C

URA10, Transcript of Minor orotate phosphoribosyltransferase (OPRTase) isozyme, yeast

Gene URA10, Length 684 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA10	YMR271C	VTC4	P47075	721 aa		4.69	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	DAL1	P32375	460 aa		4.68	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	KTR7	P40504	517 aa		4.68	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	MSN5	P52918	1224 aa		4.68	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
URA10	YMR271C	MRX10	Q05648	414 aa		4.68	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	SUM1	P46676	1062 aa		4.67	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	TSC13	Q99190	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	HAP4	P14064	554 aa		4.66	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	NTH2	P35172	780 aa		4.66	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	MDJ1	P35191	511 aa		4.66	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	SLX8	P40072	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	ROG3	P43602	733 aa		4.66	□□□□□ -1.66
URA10	YMR271C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	UBP15	P50101	1230 aa		4.65	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	SWI5	P08153	709 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	SSN3	P39073	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	YTA6	P40328	754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	PHO87	P25360	923 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	LYS5	P50113	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	IRE1	P32361	1115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	CEM1	P39525	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	CWH41	P53008	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	GAS4	Q08271	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	PHM7	Q12252	991 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	DPH6	Q12429	685 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	CYT1	P07143	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	GAL2	P13181	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	PEP12	P32854	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	JJJ2	P46997	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	RLF2	Q12495	606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	VAN1	P23642	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	TTI1	P36097	1038 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	ECM23	Q02710	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	CPS1	P27614	576 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	TGL4	P36165	910 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	CUZ1	P53899	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
URA10	YMR271C	CCP1	P00431	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	MCM1	P11746	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	DIT1	P21623	536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	TRS33	Q99394	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	FPS1	P23900	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	UBX7	P38349	436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	SLA1	P32790	1244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	SCD5	P34758	872 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	MRPL16	P38064	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	NSG2	P53898	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	JJJ3	P47138	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	STB3	Q12427	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	UBP1	P25037	809 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	ROM1	P53046	1155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	MTO1	P53070	669 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.53	□□□□□ -1.68
URA10	YMR271C	AI1	P03875	834 aa		4.52	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	MLF3	P32047	452 aa		4.52	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	PSH1	Q12161	406 aa		4.52	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	YFL066C	P43538	392 aa		4.51	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.51	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	PUN1	Q06991	263 aa		4.51	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	THI72	Q08579	599 aa		4.51	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	RGP1	P16664	663 aa		4.5	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	PUP1	P25043	261 aa		4.5	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	YBR287W	P38355	427 aa		4.5	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	KAP122	P32767	1081 aa		4.49	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	RRN6	P32786	894 aa		4.49	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	MET1	P36150	593 aa		4.49	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	SPR3	P41901	512 aa		4.48	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	YNL165W	P53891	406 aa		4.48	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	HEH2	Q03281	663 aa		4.48	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.47	□□□□□ -1.69	not detected
URA10	YMR271C	DYS1	P38791	387 aa		4.47	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	YNR014W	P53719	212 aa		4.47	□□□□□ -1.69
URA10	YMR271C	SRS2	P12954	1174 aa		4.46	□□□□□ -1.7

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