RNA–Protein interactions for RNA: YKL204W

EAP1, Transcript of eIF4E-associated protein, competes with eIF4G for binding to eIF4E, yeast

Gene EAP1, Length 1,899 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EAP1	YKL204W	WTM2	Q12206	467 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	CDC4	P07834	779 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	BDS1	Q08347	646 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	TRS33	Q99394	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	SRS2	P12954	1174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	TBS1	P38114	1094 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	HST3	P53687	447 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	GCR2	Q01722	534 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	UBP1	P25037	809 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	SLD2	P34252	453 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	IPL1	P38991	367 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	MDJ2	P42834	146 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	ASH1	P34233	588 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	UGA3	P26370	528 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	YHL050C	P38721	697 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	YHR219W	P38900	624 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	QDR1	P40475	563 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EAP1	YKL204W	ISC10	P32645	267 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	YBR197C	P38306	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	CWH41	P53008	833 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	CAB1	Q04430	367 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	BRE2	P43132	505 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	AFT1	P22149	690 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	SUM1	P46676	1062 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	ATG1	P53104	897 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	RPB10	P22139	70 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	RRN6	P32786	894 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	DLD1	P32891	587 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	HXT5	P38695	592 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	AAD14	P42884	376 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	YNL165W	P53891	406 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	WHI5	Q12416	295 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	FRT1	Q99332	602 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	NUT2	Q06213	157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	SRF1	Q12516	437 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	YJR115W	P47152	169 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	SSN3	P39073	555 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	THI12	P42883	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	THI5	P43534	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	THI11	P47183	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	THI13	Q07748	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	ARG82	P07250	355 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	HEM3	P28789	327 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	RTT106	P40161	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	MCM1	P11746	286 aa		4.65	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	MLF3	P32047	452 aa		4.65	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	KTR2	P33550	425 aa		4.65	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	ACF4	P47129	309 aa		4.65	□□□□□ -1.66
EAP1	YKL204W	MRPL33	P20084	86 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	SEC20	P28791	383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	JJJ2	P46997	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	ATE1	P16639	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	VMA3	P25515	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	PPX1	P38698	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
EAP1	YKL204W	SCD5	P34758	872 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	ALD2	P47771	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	APC11	Q12157	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	POL32	P47110	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	YJR098C	P47139	656 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	MET4	P32389	672 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	QDR2	P40474	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	MSN5	P52918	1224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	IRE1	P32361	1115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	SLA1	P32790	1244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	SPR3	P41901	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	MNL2	Q12205	849 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	NUP85	P46673	744 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EAP1	YKL204W	MTO1	P53070	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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