RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	ATG3	P40344	310 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	VTC4	P47075	721 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	CUZ1	P53899	274 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	SWI5	P08153	709 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	SUM1	P46676	1062 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	MSN5	P52918	1224 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YKL063C	YKL063C	NTH2	P35172	780 aa		6.02	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	JJJ2	P46997	583 aa		6.02	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	PEP12	P32854	288 aa		6.01	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	MDJ1	P35191	511 aa		6.01	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	UBP15	P50101	1230 aa		6.01	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	YNL165W	P53891	406 aa		6	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	IRE1	P32361	1115 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	YPQ2	Q06328	317 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	CEM1	P39525	442 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	PSH1	Q12161	406 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	DIT1	P21623	536 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	JJJ3	P47138	172 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	LYS5	P50113	272 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YKL063C	YKL063C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	DPH6	Q12429	685 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	TSC13	Q99190	310 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	SYT1	Q06836	1226 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	MRPL16	P38064	232 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	YFL034W	P43564	1073 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	CYT1	P07143	309 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	CPS1	P27614	576 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	MLF3	P32047	452 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	THI72	Q08579	599 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	STB3	Q12427	513 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	PHO87	P25360	923 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	TTI1	P36097	1038 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	ALD2	P47771	506 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	ROM1	P53046	1155 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	ECM23	Q02710	187 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YKL063C	YKL063C	TGL4	P36165	910 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	NSG2	P53898	299 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	YFL066C	P43538	392 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	GAL2	P13181	574 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	FPS1	P23900	669 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	ICP55	P40051	511 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	SPR3	P41901	512 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	AI1	P03875	834 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	MCM1	P11746	286 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	HAP4	P14064	554 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	MTC5	Q03897	1148 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	UBX7	P38349	436 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	MTO1	P53070	669 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	GAS4	Q08271	471 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKL063C	YKL063C	YTA6	P40328	754 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	RGP1	P16664	663 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	PUP1	P25043	261 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	MSC7	P38694	644 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	HXT5	P38695	592 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	YML083C	Q04526	418 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	SUV3	P32580	737 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	TDA6	Q06466	467 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	UBP1	P25037	809 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	YNR014W	P53719	212 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	SIS2	P36024	562 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	PHM7	Q12252	991 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	VAN1	P23642	535 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YKL063C	YKL063C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.78	□□□□□ -1.48	RIP-Chip
YKL063C	YKL063C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	YNR040W	P53736	256 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	CAB1	Q04430	367 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	QDR2	P40474	542 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	BOI2	P39969	1040 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	KAP122	P32767	1081 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	SCD5	P34758	872 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49

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