RNA–Protein interactions for RNA: YHR066W

SSF1, Transcript of Constituent of 66S pre-ribosomal particles, yeast

Gene SSF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSF1	YHR066W	ATG20	Q07528	640 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	MKS1	P34072	584 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	FBP26	P32604	452 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	SKN7	P38889	622 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	CPS1	P27614	576 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	ATG3	P40344	310 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	VTC4	P47075	721 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	ISU1	Q03020	165 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SSF1	YHR066W	STE6	P12866	1290 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	CEM1	P39525	442 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	KTR7	P40504	517 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	SIS2	P36024	562 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	TDA6	Q06466	467 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	BDS1	Q08347	646 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	TGL4	P36165	910 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	HDA3	Q06623	655 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.13	□□□□□ -1.59	not detected
SSF1	YHR066W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	PUP1	P25043	261 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	SYT1	Q06836	1226 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	DAL1	P32375	460 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	UTR2	P32623	467 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	YMR187C	Q03236	431 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	WTM2	Q12206	467 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	GAL2	P13181	574 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	SLX8	P40072	274 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SSF1	YHR066W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	ECM23	Q02710	187 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	YML083C	Q04526	418 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	TSC13	Q99190	310 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	PHO87	P25360	923 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	DIT1	P21623	536 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	SWI5	P08153	709 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	HAP4	P14064	554 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	NTH2	P35172	780 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	TBS1	P38114	1094 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	YFL034W	P43564	1073 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	ROM1	P53046	1155 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	UBX7	P38349	436 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	UBP15	P50101	1230 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	GAS4	Q08271	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	SSN3	P39073	555 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	SUM1	P46676	1062 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SSF1	YHR066W	YNR014W	P53719	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	YPQ2	Q06328	317 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	SLA1	P32790	1244 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	YDR215C	Q12240	137 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	CYT1	P07143	309 aa		5	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	UBP1	P25037	809 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	MSN5	P52918	1224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	MCA1	Q08601	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	VAN1	P23642	535 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	SUV3	P32580	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSF1	YHR066W	MCM1	P11746	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	JJJ2	P46997	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	YNL165W	P53891	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	BOI2	P39969	1040 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	LSB6	P42951	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	TRS33	Q99394	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	GEF1	P37020	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	HXT5	P38695	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	IRE1	P32361	1115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	PUN1	Q06991	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSF1	YHR066W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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