RNA–Protein interactions for RNA: YGL063C-A

YGL063C-A, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YGL063C-A, Length 150 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL063C-A	YGL063C-A	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	SIT4	P20604	311 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	SPR3	P41901	512 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	TEA1	P47988	759 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	SAS4	Q04003	481 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	STV1	P37296	890 aa		5	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	YFL040W	P43562	540 aa		5	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	GAS4	Q08271	471 aa		5	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		5	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	ESL2	P36168	1195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	CRF1	Q04930	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	CBP1	P07252	654 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	DSF2	P38213	736 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	MSC7	P38694	644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	HIP1	P06775	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YGL063C-A	YGL063C-A	ATG1	P53104	897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	ZDS2	P54786	942 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	YPL034W	Q03083	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	STB3	Q12427	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	VID30	P53076	958 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	YGL082W	P53155	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	ECM30	Q06673	1274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	PMD1	P32634	1753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	IXR1	P33417	597 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	AVT3	P36062	692 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	KTR4	P38131	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	YOR131C	Q12486	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	PEX29	Q03370	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	SSM4	P40318	1319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	UIP5	P36137	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YGL063C-A	YGL063C-A	RMT2	Q03305	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	MAM3	Q12296	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YGL063C-A	YGL063C-A	GSC2	P40989	1895 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGL063C-A	YGL063C-A	GAL2	P13181	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	MDG1	P53885	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	FMP30	Q02883	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	LYS2	P07702	1392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	SPE2	P21182	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	SPT21	P35209	758 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	GSM1	P42950	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	RTF1	P53064	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	IRE1	P32361	1115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	UBP16	Q02863	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	GAS5	Q08193	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	DAP1	Q12091	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	GIN4	Q12263	1142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	RDH54	P38086	958 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	ERG7	P38604	731 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	NIT1	P40447	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	SET4	P42948	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	YJL007C	P47080	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	FAB1	P34756	2278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	PHM7	Q12252	991 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	CAN1	P04817	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YGL063C-A	YGL063C-A	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	FLO1	P32768	1537 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	NUP145	P49687	1317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
YGL063C-A	YGL063C-A	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	YJR107W	P47145	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	SUT2	Q12286	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	MIP1	P15801	1254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	KTR2	P33550	425 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	MCD4	P36051	919 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	ICL2	Q12031	575 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	YML133C	Q03099	1374 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	SRS2	P12954	1174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	ALE1	Q08548	619 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	HAT1	Q12341	374 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	SSP2	Q08646	371 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YGL063C-A	YGL063C-A	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms