RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myo3aQ8K3H5 1613 aa32.06■■■□□ 2.72
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trak1Q6PD31 939 aa32.03■■■□□ 2.72
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tecpr2Q3UH45 1423 aa32.02■■■□□ 2.72
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tarbp1E9Q368 1579 aa32.02■■■□□ 2.72
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Uggt1Q6P5E4 1551 aa32.01■■■□□ 2.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psme1P97371 249 aa31.98■■■□□ 2.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stk24Q99KH8 431 aa31.98■■■□□ 2.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PplQ9R269 1755 aa31.98■■■□□ 2.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa31.96■■■□□ 2.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa31.92■■■□□ 2.7
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pkd2O35245 966 aa31.88■■■□□ 2.69
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa31.88■■■□□ 2.69
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IghaA0A0A6YXW6 389 aa31.87■■■□□ 2.69
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PalldQ9ET54 1408 aa31.86■■■□□ 2.69
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abca8aQ8K442 1620 aa31.85■■■□□ 2.69
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sall3Q62255 1320 aa31.82■■■□□ 2.68
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Amigo3Q8C2S7 508 aa31.82■■■□□ 2.68
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pik3c2gO70167 1506 aa31.8■■■□□ 2.68
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa31.79■■■□□ 2.68
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col18a1P39061 1774 aa31.79■■■□□ 2.68
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgef28P97433 1693 aa31.78■■■□□ 2.68
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tns3Q5SSZ5 1440 aa31.68■■■□□ 2.66
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp1b4Q99ME6 356 aa31.67■■■□□ 2.66
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tom1O88746 492 aa31.64■■■□□ 2.66
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Evi5lH3BKQ3 813 aa31.63■■■□□ 2.65
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NefmP08553 848 aa31.63■■■□□ 2.65
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pik3c2aQ61194 1686 aa31.62■■■□□ 2.65
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slain2Q8CI08 581 aa31.56■■■□□ 2.64
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arap3Q8R5G7 1538 aa31.55■■■□□ 2.64
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q9D9H8 365 aa31.54■■■□□ 2.64
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rock1P70335 1354 aa31.54■■■□□ 2.64
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pik3r4Q8VD65 1358 aa31.47■■■□□ 2.63
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa31.44■■■□□ 2.62
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem94Q7TSH8 1360 aa31.43■■■□□ 2.62
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Washc2Q6PGL7 1334 aa31.43■■■□□ 2.62
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col14a1Q80X19 1797 aa31.42■■■□□ 2.62
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttll13A4Q9F6 804 aa31.4■■■□□ 2.62
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbln2P37889 1221 aa31.4■■■□□ 2.62
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nwd1A6H603 1563 aa31.39■■■□□ 2.62
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ift172Q6VH22 1749 aa31.39■■■□□ 2.62
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rgl3Q3UYI5 709 aa31.39■■■□□ 2.62
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif7B7ZNG0 1348 aa31.37■■■□□ 2.61
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atf3Q60765 181 aa31.36■■■□□ 2.61
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NalcnQ8BXR5 1738 aa31.35■■■□□ 2.61
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MaddQ80U28 1577 aa31.34■■■□□ 2.61
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa31.32■■■□□ 2.6
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TonslQ6NZL6 1363 aa31.3■■■□□ 2.6
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cps1Q8C196 1500 aa31.29■■■□□ 2.6
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dapk1Q80YE7 1442 aa31.26■■■□□ 2.6
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tulp4Q9JIL5 1547 aa31.26■■■□□ 2.59
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slit2Q9R1B9 1521 aa31.26■■■□□ 2.59
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Qtrt2B8ZXI1 415 aa31.26■■■□□ 2.59
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rims1Q99NE5 1463 aa31.25■■■□□ 2.59
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cypt2Q6P924 180 aa31.19■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa31.19■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp142G5E869 1843 aa31.18■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Neurod1Q60867 357 aa31.16■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stk26Q99JT2 416 aa31.16■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa31.16■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 KdrP35918 1367 aa31.15■■■□□ 2.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
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