RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023958.9

P3h3-201, Transcript of Prolyl 3-hydroxylase 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3h3, Length 2,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3h3-201ENSMUST00000023958 AknaQ80VW7 1404 aa28.58■■■□□ 2.17
P3h3-201ENSMUST00000023958 Arhgap5P97393 1501 aa28.58■■■□□ 2.17
P3h3-201ENSMUST00000023958 Neo1P97798 1493 aa28.57■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa28.57■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ppm1gQ61074 542 aa28.56■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Mre11Q61216 706 aa28.56■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28.56■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ak7Q9D2H2 614 aa28.53■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Adamts13Q769J6 1426 aa28.52■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ttc41Q692V3 1318 aa28.52■■■□□ 2.16
P3h3-201ENSMUST00000023958 Pde4cQ3UEI1 686 aa28.51■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Kif7B7ZNG0 1348 aa28.5■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Sall3Q62255 1320 aa28.5■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa28.49■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Armcx1Q9CX83 456 aa28.49■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.48■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Fancd2Q80V62 1450 aa28.48■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Pank1Q8K4K6 548 aa28.46■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ipo8Q7TMY7 1010 aa28.46■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
P3h3-201ENSMUST00000023958 Map3k5O35099 1380 aa28.45■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Polr3glQ8R0C0 218 aa28.43■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Golga2Q921M4 999 aa28.43■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.43■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Gm20521D3Z5F7 333 aa28.42■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Sbno1Q689Z5 1390 aa28.41■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Cnga1P29974 684 aa28.4■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Usp19Q3UJD6 1360 aa28.39■■■□□ 2.14
P3h3-201ENSMUST00000023958 Gm6268A2A3U9 297 aa28.38■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa28.37■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Atf7ipQ7TT18 1306 aa28.37■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Tulp4Q9JIL5 1547 aa28.37■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ccdc183A2AJB1 534 aa28.37■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Trim26Q99PN3 545 aa28.36■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Fgd1P52734 960 aa28.36■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa28.33■■■□□ 2.13
P3h3-201ENSMUST00000023958 Stk24Q99KH8 431 aa28.33■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa28.32■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Fan1Q69ZT1 1020 aa28.31■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Spryd3E9Q9B3 442 aa28.3■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.3■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Mast1Q9R1L5 1570 aa28.29■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ipo4Q8VI75 1082 aa28.28■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Rlbp1Q9Z275 317 aa28.28■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 AI481877A2ALV5 1481 aa28.28■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Usp40Q8BWR4 1235 aa28.27■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
P3h3-201ENSMUST00000023958 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Cep170Q6A065 1588 aa28.26■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Col17a1Q07563 1470 aa28.25■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa28.23■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Abcc6Q9R1S7 1498 aa28.23■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Uspl1Q3ULM6 1089 aa28.22■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa28.22■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Prdm16A2A935 1275 aa28.22■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ralbp1Q62172 648 aa28.21■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Nsd2Q8BVE8 1365 aa28.2■■■□□ 2.11
P3h3-201ENSMUST00000023958 Zmym3Q9JLM4 1370 aa28.2■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Gm14025A2AP89 1413 aa28.19■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Pdlim2Q8R1G6 349 aa28.18■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Trim58Q5NCC9 485 aa28.17■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Kif3bQ61771 747 aa28.17■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa28.17■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Rnf17Q99MV7 1640 aa28.16■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Pola1P33609 1465 aa28.15■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Robo2Q7TPD3 1470 aa28.15■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Cluap1Q8R3P7 413 aa28.14■■■□□ 2.1
P3h3-201ENSMUST00000023958 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Pnmal2G3X9N3 661 aa28.13■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Htatsf1Q8BGC0 757 aa28.13■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ksr2Q3UVC0 959 aa28.11■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Cfap74Q3UY96 1578 aa28.11■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Rusc2Q80U22 1514 aa28.1■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa28.1■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Apaf1O88879 1249 aa28.1■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa28.09■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
P3h3-201ENSMUST00000023958 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28.07■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 Tmc1Q8R4P5 757 aa28.07■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 Znf521Q6KAS7 1311 aa28.07■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 GsdmaQ9EST1 446 aa28.07■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 ShprhQ7TPQ3 1674 aa28.06■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 P2rx7Q9Z1M0 595 aa28.06■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa28.05■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 Neurl4Q5NCX5 1563 aa28.04■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 Fgd6Q69ZL1 1399 aa28.04■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa28.04■■■□□ 2.08
P3h3-201ENSMUST00000023958 ErbinQ80TH2 1402 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.5 ms