RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	TAF4	P50105	388 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	UFD1	P53044	361 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	FMP48	P53233	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PRM15	Q03262	622 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	LIP2	Q06005	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	FCY22	Q12119	530 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	BBP1	Q12365	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	AAC1	P04710	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	HNM1	P19807	563 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	CPR4	P25334	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SRL3	P36167	246 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	POP8	P38208	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YHL037C	P38733	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RRF1	P38771	230 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	LNP1	P38878	278 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SLM1	P40485	686 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SOL1	P50278	321 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	BUD25	P85052	153 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MEH1	Q02205	184 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	GAL1	P04385	528 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MSI1	P13712	422 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	CKA1	P15790	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	IMP1	P28627	190 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	OCH1	P31755	480 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	ACB1	P31787	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	VAM7	P32912	316 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YHL044W	P38727	235 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YIL077C	P40508	320 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YIL060W	P40519	144 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	ECM18	Q04623	453 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MEC1	P38111	2368 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MTC7	P32633	139 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	FIG1	P38224	298 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PRM5	P40476	318 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YGR210C	P42942	411 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YFL051C	P43552	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	XPT1	P47165	209 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PHB2	P50085	310 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	NIF3	P53081	288 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YNL046W	P53956	172 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SKO1	Q02100	647 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SYM1	Q06563	197 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YNG1	Q08465	219 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	DGK1	Q12382	290 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	QCR2	P07257	368 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	MNS1	P32906	549 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YPC1	P38298	316 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	VMA22	P38784	181 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PHM8	P40025	321 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	GWT1	P47026	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PKP2	P53170	491 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	OKP1	P53298	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	TIM10	P87108	93 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SED1	Q01589	338 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PLP1	Q04004	230 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	API2	Q04413	109 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	RTT103	Q05543	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	FEX1	Q08913	375 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
TRM10	YOL093W	RTR2	Q12378	196 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	PUT1	P09368	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	SEN2	P16658	377 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRM10	YOL093W	STF2	P16965	84 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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