RNA–Protein interactions for RNA: YMR228W

MTF1, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase specificity factor, yeast

Gene MTF1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTF1	YMR228W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	COX5A	P00424	153 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	YEL075C	P39972	122 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	MEP2	P41948	499 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	OST3	P48439	350 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	NNT1	Q05874	261 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	MRX4	Q12467	430 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTF1	YMR228W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	SUR2	P38992	349 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YJL016W	P47072	561 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	BXI1	P48558	297 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YGL262W	P53054	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	MMS2	P53152	137 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	PDR17	P53844	350 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YNL046W	P53956	172 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	ARO80	Q04052	950 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	MCH1	Q07376	486 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	EMP46	Q12396	444 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	ERD2	P18414	219 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	DBF2	P22204	572 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	SPS18	P32572	300 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	PRY2	P36110	329 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
MTF1	YMR228W	COQ5	P49017	307 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	EMC4	P53073	190 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	TOS8	P53147	276 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	PRM15	Q03262	622 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	MEC1	P38111	2368 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	MET2	P08465	486 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	CAF4	P36130	643 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	SHG1	P38337	142 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	ARN2	P38724	620 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	POG1	P40473	351 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	CIS3	P47001	227 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	ILM1	P47155	203 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YGL159W	P53110	370 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YML108W	Q03759	105 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	ECM19	Q06011	112 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	UBR1	P19812	1950 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	COS2	P0CX12	379 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	COS3	P0CX13	379 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	GCN3	P14741	305 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	SRY1	P36007	326 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YER189W	P40104	122 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	SYS1	P41544	203 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	COS4	P43542	379 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	SDT1	P53078	280 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	CAX4	P53223	239 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	PIR1	Q03178	341 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	GRE1	Q08969	168 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YPS3	Q12303	508 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YHL044W	P38727	235 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YGR018C	P53211	109 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YNG1	Q08465	219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	PEX17	P40155	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YJR056C	P47115	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	PGU1	P47180	361 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	UFD1	P53044	361 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	TVP15	Q03860	143 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	ATG5	Q12380	294 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MTF1	YMR228W	YAK1	P14680	807 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YEL045C	P32616	141 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	APS1	P35181	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	MRPL28	P36527	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	SRP14	P38985	146 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YGL034C	P53186	121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	RSM27	P53305	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YML096W	Q04489	525 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	ATG10	Q07879	167 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	SLD7	Q08457	257 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	RPB9	P27999	122 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	OAC1	P32332	324 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YET1	P35723	206 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTF1	YMR228W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75

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