RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YDR248C	Q03786	193 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YML096W	Q04489	525 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YHR139C-A	O13536	103 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	QCR7	P00128	127 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	OAC1	P32332	324 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	SPS18	P32572	300 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	VPS51	P36116	164 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YAP3	P38749	330 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	GTR2	P53290	341 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	RSM10	Q03201	203 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	GDB1	Q06625	1536 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	KRE1	P17260	313 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	SPO73	P40031	143 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	OST2	P46964	130 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	IRC18	P47056	224 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YOR268C	Q08734	132 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	ULS1	Q08562	1619 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	FCY2	P17064	533 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	APS1	P35181	156 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YAR068W	P39564	161 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	BMT5	P40493	336 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	FIS1	P40515	155 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	PDR17	P53844	350 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YMD8	Q03697	442 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	YML108W	Q03759	105 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	SAS5	Q99314	248 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	SNT2	P53127	1403 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	USO1	P25386	1790 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MGR3	YMR115W	GCN3	P14741	305 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YKR032W	P36127	104 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YER188W	P40103	239 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.78	□□□□□ -1.97	not detected
MGR3	YMR115W	YGL088W	P53151	121 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	CDD1	Q06549	142 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	GPM2	Q12008	311 aa		2.78	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	SNF6	P18888	332 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	MIG1	P27705	504 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TRM5	P38793	499 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YHR125W	P38831	101 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	ABF2	Q02486	183 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	PEX12	Q04370	399 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	MYO4	P32492	1471 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
MGR3	YMR115W	DOG2	P38773	246 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	DOG1	P38774	246 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	MTW1	P39731	289 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	FAR7	P43592	221 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	RPA43	P46669	326 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	PRM8	P53174	237 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	ATG39	Q06159	398 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YBR063C	P38083	404 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YJR056C	P47115	236 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	HRT1	Q08273	121 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	IQG1	Q12280	1495 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YPR096C	O13587	100 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	Q0255	P03881	472 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	POG1	P40473	351 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	MMS2	P53152	137 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YJL016W	P47072	561 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	PRM15	Q03262	622 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YMR279C	Q03263	540 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YET3	Q07451	203 aa		2.73	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17 ms