RNA–Protein interactions for RNA: YLR018C

POM34, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeastyeast

Gene POM34, Length 900 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34YLR018C HUG1Q6Q5K6 68 aa8.34□□□□□ -1.07
POM34YLR018C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa8.34□□□□□ -1.07
POM34YLR018C MAG1P22134 296 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YPC1P38298 316 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SSO2P39926 295 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C CWC25P53854 179 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C MRPL22P53881 309 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YOR029WQ12243 111 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YGL015CP33199 130 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data8.32□□□□□ -1.08not detected
POM34YLR018C IRC24P40580 263 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PIR5P46999 287 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C RRT7Q07829 113 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YCT1Q12235 531 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C TFC7Q12415 435 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SEC22P22214 214 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ERG2P32352 222 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PHM8P40025 321 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PRM5P40476 318 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C XPT1P47165 209 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YGL262WP53054 175 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C JAC1P53193 184 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C VPS28Q02767 242 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ASM4Q05166 528 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YDL086WQ07505 273 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YFH1Q07540 174 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SNA4Q07549 140 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YOR292CQ08743 309 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C NUM1Q00402 2748 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C CUE1P38428 203 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C GEP4P38812 185 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PCL7P40186 285 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SBH2P52871 88 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C GEP7P53171 287 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C WSC3Q12215 556 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C REC104P33323 182 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SWM2P40342 146 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YHC3P47040 408 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C TAD2P47058 250 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C INN1P53901 409 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C DGK1Q12382 290 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YBL029C-AQ3E756 94 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ATP10P18496 279 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C COQ2P32378 372 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PDC2P32896 925 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ERV15P38312 142 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YIL012WP40551 113 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C TTI2P47168 421 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SMM1P53720 384 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YNR064CP53750 290 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C WSC2P53832 503 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YDL009CQ12210 107 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C RTR2Q12378 196 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C CPR5P35176 225 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YHL044WP38727 235 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C IKI1P38874 309 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C NCA3P46955 337 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YJR012CP47087 207 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C PNC1P53184 216 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ORM1P53224 222 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C DID2P69771 204 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ANT1Q06497 328 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C IRC25Q07951 179 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YOL029CQ08187 201 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C GDH1P07262 454 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C MRS4P23500 304 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C LSB5P25369 354 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YFL015CP43578 164 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C PKP2P53170 491 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C GPI15P53961 229 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ACT1P60010 375 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ECM18Q04623 453 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ISC10P32645 267 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C SIT1P39980 628 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YIR020CP40575 100 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C PAM18Q07914 168 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C FMP16Q12497 93 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C APA2P22108 325 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C SRY1P36007 326 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C AGX1P43567 385 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C LPP1Q04396 274 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C HRD1Q08109 551 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ATG5Q12380 294 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C SPO24Q3E752 67 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YOS1Q3E834 85 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ISN1Q99312 450 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ROX3P25046 220 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.4 ms