RNA–Protein interactions for RNA: YLL008W

DRS1, Transcript of Nucleolar DEAD-box protein required for ribosome assembly and function, yeast

Gene DRS1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRS1	YLL008W	MRH4	P53166	561 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YGL034C	P53186	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	MRPL39	P36533	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	TIM17	P39515	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	PAC10	P48363	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	JAC1	P53193	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	HRT3	Q12347	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	AGC1	Q12482	902 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	PET20	Q99373	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	OAC1	P32332	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	OXA1	P39952	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YJL016W	P47072	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	BXI1	P48558	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	FMP48	P53233	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	MSA1	Q08471	629 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	EMP46	Q12396	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	IMP1	P28627	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	ECM13	P38195	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	AAH1	P53909	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	NHP10	Q03435	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	GCN3	P14741	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YGR201C	P42936	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	GTR2	P53290	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	COA4	Q05809	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	LIP2	Q06005	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	IRC25	Q07951	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	NDD1	Q08887	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	EFM1	P38732	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	PRM10	P42946	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RNH201	P53942	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	PET191	Q02772	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	GRX8	Q05926	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CDC8	P00572	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YKR041W	P36134	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	PEX17	P40155	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YIL012W	P40551	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	FAR7	P43592	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	LDB18	Q07887	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	TFC1	P32367	649 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CSG2	P35206	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	BDH1	P39714	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RMD6	P39975	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RRG9	P40156	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	MRX11	Q03079	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	SOL2	P37262	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	ARL3	Q02804	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	NKP2	Q06162	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	TRM10	Q12400	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CNB1	P25296	175 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	YBL059W	P34224	193 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	TIP20	P33891	701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	SEO1	P39709	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	DYN2	Q02647	92 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	PPT2	Q12036	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	UBC8	P28263	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	UPS2	P35200	230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	DER1	P38307	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	ECM14	P38836	430 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	MIG3	P39943	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	UFD1	P53044	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	MRS1	P07266	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	NVJ1	P38881	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DRS1	YLL008W	DID2	P69771	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.5 ms