RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	PET20	Q99373	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SPS2	P08459	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	PET122	P10355	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ACH1	P32316	526 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SPS18	P32572	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YBL010C	P32788	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	RPB7	P34087	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	MRPL3	P36516	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SWD3	P38123	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	CTR2	P38865	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	POP2	P39008	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	PAC2	P39937	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	BNA2	P47125	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SOL1	P50278	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	MRPL22	P53881	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ASM4	Q05166	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	FRE8	Q12209	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ATG40	Q99325	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	REP2	P03872	296 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ARG80	P07249	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	PUP1	P25043	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ATG22	P25568	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ERG3	P32353	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	IES6	P32617	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	EDS1	P38073	919 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YBR242W	P38331	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	BMT5	P40493	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	GPG1	P53130	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YNR064C	P53750	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	GIM3	P53900	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	INN1	P53901	409 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	CAC2	Q04199	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	DGK1	Q12382	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	GEP5	Q12393	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	PUT1	P09368	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YUH1	P35127	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	PIR5	P46999	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	MSE1	P48525	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	OKP1	P53298	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	RSM27	P53305	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	PRM15	Q03262	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YML018C	Q03730	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SOR2	Q07786	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	VAM3	Q12241	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SEN2	P16658	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ATP10	P18496	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	TCA17	P32613	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	NPL6	P32832	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	FIG1	P38224	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YPC1	P38298	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YJL118W	P47022	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	RPA14	P50106	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	HSK3	P69852	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	NRG1	Q03125	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	SCP1	Q08873	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	UBA3	Q99344	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	MRP20	P32387	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	VMA11	P32842	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	PPQ1	P32945	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	AIM46	P38885	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	NIF3	P53081	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	VBA1	Q04301	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	FIT1	Q04433	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	ARR2	Q06597	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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