RNA–Protein interactions for RNA: YML071C

COG8, Transcript of Component of the conserved oligomeric Golgi complex, yeast

Gene COG8, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COG8	YML071C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	UPS2	P35200	230 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	KDX1	P36005	433 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	TCD1	P38756	429 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	APE4	P38821	490 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	VOA1	P53262	265 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	YMR279C	Q03263	540 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	YLR162W	Q06235	118 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
COG8	YML071C	DBF2	P22204	572 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	OAC1	P32332	324 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SMI1	P32566	505 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	TIM21	P53220	239 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	CPD1	P53314	239 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	PER33	Q12144	273 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	GPA2	P10823	449 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	VMA11	P32842	164 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	HIS2	P38635	335 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SSO2	P39926	295 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SER33	P40510	469 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SFH1	Q06168	426 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	BBP1	Q12365	385 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RIF1	P29539	1916 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	FLO9	P39712	1322 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	TRS20	P38334	175 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YHL049C	P38722	271 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YHR125W	P38831	101 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	HUA1	P40325	198 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	NAS2	P40555	220 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SML1	Q04964	104 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	CTR3	Q06686	241 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	EMP46	Q12396	444 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SNA3	P14359	133 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RPC25	P35718	212 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.25	□□□□□ -2.37	not detected
COG8	YML071C	AGE2	P40529	298 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YPR011C	Q12251	326 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	HKR1	P41809	1802 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SEC22	P22214	214 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SVP26	P38869	228 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YIL001W	P40560	513 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	NBP35	P52920	328 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	MAL13	P53338	473 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	GPI12	P23797	304 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	VPS71	Q03433	280 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.24	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YLR462W	O13556	202 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	QCR8	P08525	94 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	UGA1	P17649	471 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	PEX34	P25584	144 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	CSM1	P25651	190 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YEL075C	P39972	122 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SWS2	P53937	143 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	AIM36	Q03798	255 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	VBA1	Q04301	562 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	RRG8	Q06109	277 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	NEJ1	Q06148	342 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	VAC14	Q06708	880 aa		0.23	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	PEX18	P38855	283 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	CTR2	P38865	189 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YER189W	P40104	122 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YGL185C	P53100	379 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	YPL162C	Q12042	273 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	COX5A	P00424	153 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	MSW1	P04803	379 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	SPP2	Q02521	185 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	BCP1	Q06338	283 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.22	□□□□□ -2.37
COG8	YML071C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	VPS45	P38932	577 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	ICE2	P40499	491 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	GAT4	P40569	121 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	TOS8	P53147	276 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	UBC7	Q02159	165 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	MGR3	Q04472	501 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	FAR8	Q05040	523 aa		0.21	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	POF1	P25576	258 aa		0.2	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	FZO1	P38297	855 aa		0.2	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	PHB1	P40961	287 aa		0.2	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	MNT4	P53745	580 aa		0.2	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YDR124W	Q04608	324 aa		0.2	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38

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