RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeastyeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR4YLR449W OSH7P38755 437 aa11.17□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W GLR1P41921 483 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W PNC1P53184 216 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W ACT1P60010 375 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W YDR286CQ05530 114 aa11.17□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W PIN3Q06449 215 aa11.17□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W FUS3P16892 353 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W GLC7P32598 312 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W LNP1P38878 278 aa11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W YIR035CP40579 254 aa11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W EGT2P42835 1041 aa11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W MRX5P47007 382 aa11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W SRB7P47822 140 aa11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W SIP18P50263 79 aa11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W TIM44Q01852 431 aa11.16□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W RPL25P04456 142 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W MSI1P13712 422 aa11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W CKA1P15790 372 aa11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W PDC2P32896 925 aa11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W FIG1P38224 298 aa11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W HNT2P49775 206 aa11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W SOL1P50278 321 aa11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W YLR108CQ12259 485 aa11.15□□□□□ -0.62
FPR4YLR449W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W RPD3P32561 433 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W RPB7P34087 171 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W COS8P38723 381 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YER079WP40052 210 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W IRC24P40580 263 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W MRPL22P53881 309 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YDC1Q02896 317 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W API2Q04413 109 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YMR254CQ04838 102 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W WHI5Q12416 295 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa11.14□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YLL053CP0CD98 152 aa11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YUH1P35127 236 aa11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W SSO2P39926 295 aa11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W FLX1P40464 311 aa11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W SUR7P54003 302 aa11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data11.13□□□□□ -0.63not detected
FPR4YLR449W FRE8Q12209 686 aa11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W EAF3Q12432 401 aa11.13□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W CLB6P32943 380 aa11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W EDS1P38073 919 aa11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W LSM12P38828 187 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W SEN34P39707 275 aa11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W UPS1Q05776 175 aa11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YJR112W-AQ3E743 109 aa11.12□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W OLE1P21147 510 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W SRY1P36007 326 aa11.11□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YHC3P47040 408 aa11.11□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W INN1P53901 409 aa11.11□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W EST3Q03096 181 aa11.11□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YOL029CQ08187 201 aa11.11□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W REP2P03872 296 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W SSA3P09435 649 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YOX1P34161 385 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W SWD3P38123 315 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YHL037CP38733 133 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W PIG2P40187 538 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W BUL1P48524 976 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W TAF4P50105 388 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YGL117WP53133 265 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W GPI15P53961 229 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W MEH1Q02205 184 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W CAC2Q04199 468 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YDL218WQ07629 317 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W RRT7Q07829 113 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa11.1□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W IMP1P28627 190 aa11.09□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W ALG12P53730 551 aa11.09□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W VPS28Q02767 242 aa11.09□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W BER1Q06688 274 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W ATG40Q99325 256 aa11.09□□□□□ -0.63
FPR4YLR449W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W ERG2P32352 222 aa11.08□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W PHO23P50947 330 aa11.08□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W ACS1Q01574 713 aa11.08□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W ASM4Q05166 528 aa11.08□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W ERV15P38312 142 aa11.07□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W GPI16P38875 610 aa11.07□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W YEA6P39953 335 aa11.07□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W AGX1P43567 385 aa11.07□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W YIF1P53845 314 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
FPR4YLR449W YPL067CQ02754 198 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.8 ms