RNA–Protein interactions for RNA: YJL075C

APQ13, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene APQ13, Length 417 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APQ13	YJL075C	TCD1	P38756	429 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	ERV29	P53337	310 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	RRT8	Q08219	342 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	MEI4	P29467	408 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	TIR3	P40552	269 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	VAR1	P02381	398 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	ERD2	P18414	219 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	RIB1	P38066	345 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	ICE2	P40499	491 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	MRPL50	P53724	139 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YML096W	Q04489	525 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	SEI1	Q06058	285 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	PAM18	Q07914	168 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	CSM4	Q08955	156 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YPL229W	Q99395	206 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	ILM1	P47155	203 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	CDC8	P00572	216 aa		0.85	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.85	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	HOC1	P47124	396 aa		0.85	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	BOL2	P53082	120 aa		0.85	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	ATG31	Q12421	196 aa		0.85	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	QCR8	P08525	94 aa		0.84	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	FZF1	P32805	299 aa		0.84	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YKL075C	P36083	450 aa		0.84	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	LDB7	P38210	180 aa		0.84	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	PGD1	P40356	397 aa		0.84	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	TRM9	P49957	279 aa		0.84	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YMD8	Q03697	442 aa		0.84	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	YLR173W	Q06247	608 aa		0.84	□□□□□ -2.27
APQ13	YJL075C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	CUE1	P38428	203 aa		0.83	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YNL217W	P40152	326 aa		0.83	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.83	□□□□□ -2.28	not detected
APQ13	YJL075C	UBC7	Q02159	165 aa		0.83	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YPL162C	Q12042	273 aa		0.83	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	PSF1	Q12488	208 aa		0.83	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	MRPL25	P23369	157 aa		0.82	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	ABF2	Q02486	183 aa		0.82	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	SRB4	P32569	687 aa		0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	KDX1	P36005	433 aa		0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YER076C	P40049	302 aa		0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YRB2	P40517	327 aa		0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	TRM12	Q04235	462 aa		0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	KRE28	Q04431	385 aa		0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	ANT1	Q06497	328 aa		0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	MED4	Q12343	284 aa		0.81	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	MRPS28	P21771	286 aa		0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	GAA1	P39012	614 aa		0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	PEX17	P40155	199 aa		0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	AIF1	P52923	378 aa		0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	DOC1	P53068	250 aa		0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	SNZ1	Q03148	297 aa		0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	ATG22	P25568	528 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	DOG2	P38773	246 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	IRC22	P40006	225 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	FMC1	P40491	155 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	EAF6	P47128	113 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YJR149W	P47177	404 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	DID2	P69771	204 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	RRN5	Q02983	363 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	LPP1	Q04396	274 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.79	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	REP2	P03872	296 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	MCM22	P47167	239 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	ALG13	P53178	202 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	YNR077C	P53758	84 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	PET117	Q02771	107 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	GAS3	Q03655	524 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	DRS2	P39524	1355 aa		0.78	□□□□□ -2.28
APQ13	YJL075C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APQ13	YJL075C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
APQ13	YJL075C	URA6	P15700	204 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APQ13	YJL075C	MRPL28	P36527	147 aa		0.77	□□□□□ -2.29
APQ13	YJL075C	NUP84	P52891	726 aa		0.77	□□□□□ -2.29

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