RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	IZH2	Q12442	317 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	ATG15	P25641	520 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	MRPL39	P36533	70 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	YHC3	P47040	408 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	CAB5	Q03941	241 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	TFC7	Q12415	435 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	EAF3	Q12432	401 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	PRM4	Q12498	284 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	SEC62	P21825	274 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	MOH1	P38191	138 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	YIR035C	P40579	254 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	GWT1	P47026	490 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	INN1	P53901	409 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	RTT103	Q05543	409 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	ANT1	Q06497	328 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.28	□□□□□ -1.56	not detected
YCK1	YHR135C	UBA3	Q99344	299 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YCK1	YHR135C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	REC114	P32841	428 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	MCH2	P36032	473 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YBR096W	P38256	230 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YER084W	P40057	128 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	FLX1	P40464	311 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	MRPL19	P53875	158 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RRT7	Q07829	113 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	GRC3	Q07845	632 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SCP1	Q08873	200 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	AEP3	Q12089	606 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	MSI1	P13712	422 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SAG1	P20840	650 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	IFM1	P25038	676 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	PEX4	P29340	183 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SWM2	P40342	146 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	BMT5	P40493	336 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SSN8	P47821	323 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RCE1	Q03530	315 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	THI74	Q04083	370 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YOR186W	Q08560	144 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	MRS4	P23500	304 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	OCH1	P31755	480 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	PDC2	P32896	925 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	FAT1	P38225	669 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YER158C	P40095	573 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	UBC12	P52491	188 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YGL260W	P53056	76 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YGL117W	P53133	265 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RFU1	Q08003	200 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	FIT3	Q08907	204 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	MED4	Q12343	284 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YPC1	P38298	316 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SSO2	P39926	295 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	TIM44	Q01852	431 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YPL077C	Q02831	240 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	TSA2	Q04120	196 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RAF1	Q06891	181 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YPL278C	Q08990	100 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	VAM3	Q12241	283 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RNH203	Q12338	110 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	GAL1	P04385	528 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	QCR2	P07257	368 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	MNS1	P32906	549 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	NAT2	P37293	288 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	EST3	Q03096	181 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YLR108C	Q12259	485 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	HEM4	P06174	275 aa		5.23	□□□□□ -1.57

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