RNA–Protein interactions for RNA: YER113C

TMN3, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeastyeast

Gene TMN3, Length 2,121 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMN3YER113C MBA1P38300 278 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YBR220CP38318 560 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SSH1P38353 490 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C PRS3P38689 320 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SMB1P40018 196 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C FCY21P40039 528 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C DOC1P53068 250 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YNR048WP53740 393 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C MRPL35Q06678 367 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C ATG41Q12048 136 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C MSH5Q12175 901 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C IES3Q12345 250 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C ORT1Q12375 292 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C HIS3P06633 220 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RPS23BP0CX30 145 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SNC2P33328 115 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C MIA40P36046 403 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RCN1P36054 211 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RPS0BP46654 252 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YJL016WP47072 561 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YGL159WP53110 370 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C POP6P53218 158 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RFU1Q08003 200 aa2.05□□□□□ -2.08
TMN3YER113C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.05□□□□□ -2.08not detected
TMN3YER113C RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SPS4P09937 338 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SPS100P13130 326 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C HXT2P23585 541 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C HOM6P31116 359 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C REC114P32841 428 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C MCH2P36032 473 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C AIM20P40451 204 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C FLX1P40464 311 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RTS2P40962 232 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C OST1P41543 476 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C PHB2P50085 310 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C UBC13P52490 153 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C MRH4P53166 561 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C INN1P53901 409 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YDC1Q02896 317 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C GPI17Q04080 534 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YMR254CQ04838 102 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YPR098CQ06089 161 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C ASR1Q06834 288 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SSK1Q07084 712 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C HEM25Q07534 307 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C PEX27Q08580 376 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SRL2Q12020 392 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RNH203Q12338 110 aa2.04□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SGA1P08019 549 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SAG1P20840 650 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YHK8P38776 514 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C HTD2P38790 280 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YIL029CP40538 142 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SYS1P41544 203 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C EGT2P42835 1041 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SER2P42941 309 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C CIN2P46670 268 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C AVT4P50944 713 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C CWC23P52868 283 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C ERV29P53337 310 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C RNH201P53942 307 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C CRZ1P53968 678 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SED1Q01589 338 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YKR005CQ02203 525 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C CTF19Q02732 369 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YMR279CQ03263 540 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C GAT3Q07928 141 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C HNM1P19807 563 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C PET18P25362 215 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C DAL80P26343 269 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SPT14P32363 452 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C SEC66P33754 206 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C IPI1P38803 334 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YND1P40009 630 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C YIL060WP40519 144 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C IRC18P47056 224 aa2.03□□□□□ -2.08
TMN3YER113C GPI14P47088 403 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
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