RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	PUT1	P09368	476 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	IFM1	P25038	676 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	PAU2	P32612	120 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MSN4	P33749	630 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	PHB2	P50085	310 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	WSC2	P53832	503 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.76	not detected
PRD1	YCL057W	NNT1	Q05874	261 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	TPO4	Q12256	659 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	FRE6	Q12473	712 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	ZRC1	P20107	442 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
PRD1	YCL057W	KRE9	P39005	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RMD6	P39975	231 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	PEX25	Q02969	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	FSH3	Q99369	266 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YEF1	P32622	495 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SFK1	P35735	353 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MRPL37	P36532	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SLM1	P40485	686 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	APQ12	P40532	138 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	CDH1	P53197	566 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	BUD25	P85052	153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MEH1	Q02205	184 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SEN15	Q04675	128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RTT103	Q05543	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SRL2	Q12020	392 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	BTS1	Q12051	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	TFC7	Q12415	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	EPT1	P22140	391 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	ERV15	P38312	142 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	ECM34	P38728	170 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	COG7	P53195	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SWC4	P53201	476 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	NRK1	P53915	240 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	QCR7	P00128	127 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	PBN1	P25580	416 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SSS1	P35179	80 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	DOA1	P36037	715 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	IML3	P38265	245 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SEN34	P39707	275 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YIL089W	P40500	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RAD17	P48581	401 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RSM27	P53305	110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	PRM1	P53835	661 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	BET5	Q03630	159 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RAD28	Q12021	506 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	PRM4	Q12498	284 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MAL32	P38158	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	VMA21	P41806	77 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	DAN1	P47178	298 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MAL12	P53341	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	PEX30	Q06169	523 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MHR1	Q06630	226 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	DCN1	Q12395	269 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	POF1	P25576	258 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	MSK1	P32048	576 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	SCM4	P32564	187 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	KKQ8	P36004	724 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	RIB5	P38145	238 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	GPI16	P38875	610 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	POG1	P40473	351 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	EMC5	P40540	141 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRD1	YCL057W	OTU1	P43558	301 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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