RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SEPT2Q15019 361 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 JADE3Q92613 823 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CAVIN3Q969G5 261 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ARAP1Q96P48 1450 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 A0A1B0GTW7 788 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 GPANK1O95872 356 aa6.18□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 SLC6A9P48067 706 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CTXN1P60606 82 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 AMPD3Q01432 767 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 RESTQ13127 1097 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 RAB39AQ14964 217 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CSRP2Q16527 193 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 COQ10AQ96MF6 247 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PNKPQ96T60 521 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 TOR3AQ9H497 397 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CUX1P39880 1505 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 DTNBO60941 627 aa6.17□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 HAUS5O94927 633 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CKBP12277 381 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 FPR1P21462 350 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PCSK1P29120 753 aa6.17□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PTPN21Q16825 1174 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 DACT2Q5SW24 774 aa6.17□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.17□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 MED15Q96RN5 788 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.17□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 KAT6AQ92794 2004 aa6.16□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 LPXNO60711 386 aa6.16□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 ZG16BQ96DA0 208 aa6.16□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 TEKT5Q96M29 485 aa6.16□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.16□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.16□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.16□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.16□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
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RBM39-241ENST00000496183 PBRM1Q86U86 1689 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PIPSLA2A3N6 862 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 UNC119BA6NIH7 251 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 MARCH11A6NNE9 402 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 GABRDO14764 452 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 AMY1AP04745 511 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 C5AR1P21730 350 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ATP8B2P98198 1209 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
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