RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 PEX26Q7Z412 305 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.26□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 MUC3BQ9H195 1237 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 CDH18Q13634 790 aa8.26□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 EHD4Q9H223 541 aa8.26□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 DNAJB2P25686 324 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP3-201ENST00000268049 SENP2Q9HC62 589 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 LZTS1Q9Y250 596 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-201ENST00000268049 CCL5P13501 91 aa8.24□□□□□ -1.09
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