RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MRX5	P47007	382 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YGR042W	P53227	271 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ZEO1	Q08245	113 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YOR365C	Q08844	703 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MMT2	Q08970	484 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SET6	Q12529	373 aa		5	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	CCH1	P50077	2039 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YPK2	P18961	677 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YCR006C	P25350	157 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TRS65	P32893	560 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PTR2	P32901	601 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MSN4	P33749	630 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YBR144C	P34215	104 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
PSH1	YOL054W	PGD1	P40356	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	POG1	P40473	351 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	AVT7	P40501	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	OTU1	P43558	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MCM22	P47167	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MTM1	P53320	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	CTF19	Q02732	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TFC7	Q12415	435 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	URA6	P15700	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	NUP1	P20676	1076 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	APA2	P22108	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
PSH1	YOL054W	CMC1	P36064	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	VPS51	P36116	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YAL037W	P39728	267 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	VPS52	P39904	641 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	GTT1	P40582	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	CIN2	P46670	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YHC3	P47040	408 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	NIF3	P53081	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YGR026W	P53217	278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TPC1	P53257	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	INP1	Q03694	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YPD1	Q07688	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MCH4	Q08268	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RLM1	Q12224	676 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ORT1	Q12375	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ODC2	Q99297	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ISN1	Q99312	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MAK32	P23060	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	FMT1	P32785	401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PPZ2	P33329	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
PSH1	YOL054W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MNL1	P38888	796 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PHB1	P40961	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ZIM17	P42844	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	TAX4	P47030	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MOG1	P47123	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	CGR1	P53188	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	YLR152C	P54072	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	BUD25	P85052	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	COQ10	Q08058	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSH1	YOL054W	HNM1	P19807	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	PPH21	P23594	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	IFM1	P25038	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	PTP1	P25044	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	PET18	P25362	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	MSK1	P32048	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	VAM7	P32912	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SNC2	P33328	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	SPT10	P35208	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	HOT13	P36078	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
PSH1	YOL054W	EMC5	P40540	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	IDP2	P41939	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	HXT14	P42833	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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