RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	NIT3	P49954	291 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YGL117W	P53133	265 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MTL1	P53214	551 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MRPL22	P53881	309 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	ADD37	Q03233	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	INP1	Q03694	420 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YDR132C	Q03900	495 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MMT2	Q08970	484 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	STF1	P01098	86 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YEF1	P32622	495 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MSY1	P48527	492 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	NBP35	P52920	328 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MRPL1	Q04599	285 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	LSB5	P25369	354 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	COQ2	P32378	372 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SLG1	P54867	378 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	PFA5	Q03289	374 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	FRE6	Q12473	712 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SGA1	P08019	549 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MNS1	P32906	549 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	THI80	P35202	319 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
RRP5	YMR229C	ERV15	P38312	142 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	AME1	P38313	324 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SDH8	P38345	138 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YIP4	P53093	235 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	RHO4	Q00246	291 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YPR127W	Q06494	345 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SWI5	P08153	709 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SEC22	P22214	214 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	LAC1	P28496	418 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
RRP5	YMR229C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SAF1	P38352	637 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	PMT6	P42934	759 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YHC3	P47040	408 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	CUZ1	P53899	274 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	TMA23	Q03525	211 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	CTS2	Q06350	511 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YOL107W	Q12239	342 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	INP53	Q12271	1107 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YDL180W	Q12301	547 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	RIP1	P08067	215 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YGL010W	P25338	174 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SPC29	P33419	253 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	UMP1	P38293	148 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	XBP1	P40489	647 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	AVT4	P50944	713 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YDR366C	P87287	132 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YPR109W	Q06104	294 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	TRS20	P38334	175 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YIL029C	P40538	142 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	TOS2	P50078	622 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	DLT1	Q04216	342 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YOR387C	Q08910	206 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	PPH21	P23594	369 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	ERG4	P25340	473 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	PET18	P25362	215 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YCL002C	P25565	263 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	ICE2	P40499	491 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	AAH1	P53909	347 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	HHT1	P61830	136 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	GEP5	Q12393	293 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SOL1	P50278	321 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YMR254C	Q04838	102 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	HRT1	Q08273	121 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SWM1	Q12379	170 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	PHO5	P00635	467 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	YPC1	P38298	316 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MPM1	P40364	252 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	SLS1	P42900	643 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	MTO1	P53070	669 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	TNA1	P53322	534 aa		3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RRP5	YMR229C	NDD1	Q08887	554 aa		3	□□□□□ -1.93

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