RNA–Protein interactions for RNA: YMR188C

MRPS17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS17, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS17	YMR188C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	HIS3	P06633	220 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	MET2	P08465	486 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YER189W	P40104	122 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	BBP1	Q12365	385 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	SSK2	P53599	1579 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	DRS2	P39524	1355 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	COX5A	P00424	153 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	SNA3	P14359	133 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	MSA2	P36157	363 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	GON7	P46984	123 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	MCM22	P47167	239 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	FYV6	P53913	173 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	MSA1	Q08471	629 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	NCB2	Q92317	146 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
MRPS17	YMR188C	RCN1	P36054	211 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	MIC26	P50087	233 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	JLP1	Q12358	412 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	URA6	P15700	204 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	CBF1	P17106	351 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	ERD2	P18414	219 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YER084W	P40057	128 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YER188W	P40103	239 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	PIR5	P46999	287 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	ILM1	P47155	203 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YGL159W	P53110	370 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	DCN1	Q12395	269 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	KOG1	P38873	1557 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YLR462W	O13556	202 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YEL075C	P39972	122 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	CAT5	P41735	233 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YJR149W	P47177	404 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	NUP57	P48837	541 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YLR030W	Q07967	263 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YPL257W	Q08974	193 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	TPO4	Q12256	659 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	EMP46	Q12396	444 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	AGC1	Q12482	902 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	SPT3	P06844	337 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	DSF1	P0CX08	502 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YNR073C	P0CX09	502 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	KRE1	P17260	313 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	TOS8	P53147	276 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YGL088W	P53151	121 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	ATG2	P53855	1592 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	YPR172W	Q06608	200 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	FEX1	Q08913	375 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	FEX2	Q08991	375 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	GET4	Q12125	312 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	DNA2	P38859	1522 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS17	YMR188C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	BUD4	P47136	1447 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	YPR096C	O13587	100 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	HTB2	P02294	131 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	DBF2	P22204	572 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	MIG1	P27705	504 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	COS8	P38723	381 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	MGA1	P53050	456 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	YML096W	Q04489	525 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	FAR8	Q05040	523 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	INM2	Q05533	292 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	YPL229W	Q99395	206 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	CHD1	P32657	1468 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	YKR032W	P36127	104 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	PEX17	P40155	199 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	OST2	P46964	130 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	RMR1	P53060	241 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	BRR6	P53062	197 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	ERV29	P53337	310 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	GIM3	P53900	129 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	YPK9	Q12697	1472 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS17	YMR188C	PEP1	P32319	1579 aa		2.7	□□□□□ -1.98

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