RNA–Protein interactions for RNA: YLL054C

YLL054C, Transcript of Putative protein of unknown function with similarity to Pip2p, yeast

Gene YLL054C, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL054C	YLL054C	TVP15	Q03860	143 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	GGA1	Q06336	557 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	CDD1	Q06549	142 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	GET4	Q12125	312 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	MRX4	Q12467	430 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	NCB2	Q92317	146 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	QCR6	P00127	147 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	RAD10	P06838	210 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	CBF1	P17106	351 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	STE18	P18852	110 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	TCD1	P38756	429 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	BMT5	P40493	336 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	FLC3	P53121	802 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	ERV29	P53337	310 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	PEX10	Q05568	337 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YPR172W	Q06608	200 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YFL012W	P43580	148 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	MIG2	P53035	382 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	NNT1	Q05874	261 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	DCN1	Q12395	269 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	SWR1	Q05471	1514 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	HTB2	P02294	131 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	URA6	P15700	204 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	CKA2	P19454	339 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	SPS18	P32572	300 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YKR041W	P36134	250 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	COG3	P40094	801 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	IRC18	P47056	224 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YJR146W	P47174	117 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	MIC26	P50087	233 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	BRR6	P53062	197 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	MRX8	Q05473	314 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	CUE1	P38428	203 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	CAT5	P41735	233 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	NUP57	P48837	541 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	PDR17	P53844	350 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	ARO80	Q04052	950 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	ATG17	Q06410	417 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YPR063C	Q12160	140 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.25
YLL054C	YLL054C	DRS2	P39524	1355 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	YLR462W	O13556	202 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	MER1	P16523	270 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	SDH4	P37298	181 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	FZO1	P38297	855 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	TEM1	P38987	245 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	YEL075C	P39972	122 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	GON7	P46984	123 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	IGO1	P53897	168 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	DIA1	P54005	336 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	TRM12	Q04235	462 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	FAR8	Q05040	523 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	YOL160W	Q08321	113 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	IES3	Q12345	250 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	TCA17	P32613	152 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	SFC1	P33303	322 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	TKL2	P33315	681 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	MRPS9	P38120	278 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	SPO73	P40031	143 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	YER189W	P40104	122 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	RMR1	P53060	241 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	BNA7	Q04066	261 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	YNG1	Q08465	219 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	FEX1	Q08913	375 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	FEX2	Q08991	375 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YLL054C	YLL054C	KRE1	P17260	313 aa		0.95	□□□□□ -2.26

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.2 ms