RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data1.19□□□□□ -2.22not detected
RPC10YHR143W-A VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data1.19□□□□□ -2.22not detected
RPC10YHR143W-A BMT5P40493 336 aa1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A CIS3P47001 227 aa1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A GLG2P47011 380 aa1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YJR056CP47115 236 aa1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YGR219WP53307 113 aa1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A SNZ2P53824 298 aa1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A RHO3Q00245 231 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A SDO1Q07953 250 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YPL257WQ08974 193 aa1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A BTS1Q12051 335 aa1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A USB1Q12208 290 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A MSW1P04803 379 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A CDC7P06243 507 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A MDH2P22133 377 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A VMA11P32842 164 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A RIB7P33312 244 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YPT52P36018 234 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YER135CP40082 130 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A HAM1P47119 197 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A GPI8P49018 411 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YNL046WP53956 172 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A NEJ1Q06148 342 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A RRS1Q08746 203 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YCT1Q12235 531 aa1.18□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A IPP1P00817 287 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A RSR1P13856 272 aa1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A GRX2P17695 143 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A OAC1P32332 324 aa1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YHR022CP38763 256 aa1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YHR127WP38833 243 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A DSE2P38844 325 aa1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YAR068WP39564 161 aa1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YKE4P40544 346 aa1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A CYT2Q00873 224 aa1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A KAP95Q06142 861 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A HTL1Q9URQ5 78 aa1.17□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A ERV15P38312 142 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A RSM25P40496 264 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A PRM10P42946 383 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A ILM1P47155 203 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A JHD2P47156 728 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A SEI1Q06058 285 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A ATG39Q06159 398 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A ARR2Q06597 130 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A MSH5Q12175 901 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A DCN1Q12395 269 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YOR020W-AQ3E824 90 aa1.16□□□□□ -2.22
RPC10YHR143W-A YOL162WP0CF19 215 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A DDI2P0CH63 225 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A DDI3P0CH64 225 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A ERD2P18414 219 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YKL075CP36083 450 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A RPF1P38805 295 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YHR180WP38868 163 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A AVT2P39981 480 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YIL001WP40560 513 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A RPA43P46669 326 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YJR079WP47126 109 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A HEM25Q07534 307 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YOL107WQ12239 342 aa1.15□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A SVP26P38869 228 aa1.14□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YMR144WP40214 342 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A MRPL50P53724 139 aa1.14□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A NIP7Q08962 181 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A TPO4Q12256 659 aa1.14□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YKR045CP36138 183 aa1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A ECM33P38248 429 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A CAT5P41735 233 aa1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A BNA6P43619 295 aa1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A HOC1P47124 396 aa1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A TOS8P53147 276 aa1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A BUD25P85052 153 aa1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A KRE28Q04431 385 aa1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YOR029WQ12243 111 aa1.13□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A FCY2P17064 533 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YGL010WP25338 174 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A RPS5P26783 225 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YUH1P35127 236 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A AGE2P40529 298 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YNR062CP53748 327 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A ABF2Q02486 183 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YML096WQ04489 525 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YLR173WQ06247 608 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A PAM18Q07914 168 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A RRT8Q08219 342 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YLR126CQ12288 251 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A MED4Q12343 284 aa1.12□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A CDC8P00572 216 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A TCP1P12612 559 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A PET9P18239 318 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A RPT5P33297 434 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A RIB1P38066 345 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YBR063CP38083 404 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YBR219CP38317 127 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A RPL33BP41056 107 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
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