RNA–Protein interactions for RNA: YHR031C

RRM3, Transcript of DNA helicase involved in rDNA replication and Ty1 transposition, yeast

Gene RRM3, Length 2,172 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRM3	YHR031C	LDB7	P38210	180 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	CUE1	P38428	203 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	BMT5	P40493	336 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YIL060W	P40519	144 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MAF1	P41910	395 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MOB2	P43563	287 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	OST3	P48439	350 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	BUL1	P48524	976 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	EXG2	P52911	562 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	LST7	P53237	242 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	GTR2	P53290	341 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	GPI15	P53961	229 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	TIM8	P57744	87 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	GRX5	Q02784	150 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	RSM10	Q03201	203 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	RCE1	Q03530	315 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	AIM34	Q03673	198 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	CCE1	Q03702	353 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	BNA5	Q05979	453 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	ANT1	Q06497	328 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	STP4	Q07351	490 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	CSI2	Q08054	341 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	NRT1	Q08485	598 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YDL177C	Q12257	170 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SOD2	P00447	233 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
RRM3	YHR031C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YCR061W	P25639	631 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MGT1	P26188	188 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MTC7	P32633	139 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YOR062C	P36025	268 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	DOG1	P38774	246 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YHR130C	P38834	111 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	RTT102	P53330	157 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	AAH1	P53909	347 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YLR460C	P54007	376 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	DAD3	P69850	94 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	PLB2	Q03674	706 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SEI1	Q06058	285 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	BSP1	Q06604	576 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	PAU23	Q07987	124 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	DAP1	Q12091	152 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	PAU17	Q12370	124 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	EAF3	Q12432	401 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SFG1	Q12507	346 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SPE1	P08432	466 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	CWP1	P28319	239 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	TMT1	P32643	299 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MRPL6	P32904	214 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	PEP8	P40335	379 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	PAU15	P40585	124 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	RPA43	P46669	326 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	CTR1	P49573	406 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MIC26	P50087	233 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	MUP1	P50276	574 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YIP4	P53093	235 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	TRM12	Q04235	462 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SUE1	Q06524	206 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	NAT5	Q08689	176 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	HUT1	Q12520	339 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	CTF3	Q12748	733 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	TY4B-J	P47024	1803 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YCR102C	P25608	368 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	DCG1	P32460	244 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	BCS1	P32839	456 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SFC1	P33303	322 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YHR177W	P38867	453 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	UME6	P39001	836 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	NIF3	P53081	288 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	SUR7	P54003	302 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RRM3	YHR031C	RHO4	Q00246	291 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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