RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW4	YGR279C	ASR1	Q06834	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	ARG80	P07249	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	SAG1	P20840	650 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	APA2	P22108	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	PEX4	P29340	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	PRE4	P30657	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MLF3	P32047	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	ACH1	P32316	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	DBF20	P32328	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YOX1	P34161	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	TOK1	P40310	691 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YJR120W	P47157	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	SSN8	P47821	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	BXI1	P48558	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YIP4	P53093	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	ECM18	Q04623	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	UPS1	Q05776	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	RSC58	Q07979	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	INP53	Q12271	1107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	GAL1	P04385	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	AAC1	P04710	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	NAT2	P37293	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	LAG1	P38703	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YHL044W	P38727	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	HPA3	P39979	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MRX5	P47007	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	ABM1	P47146	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	XPT1	P47165	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	UBC13	P52490	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	SBH2	P52871	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	CRZ1	P53968	678 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	ASI3	P53983	676 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	LIP2	Q06005	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	SPS2	P08459	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	NPL6	P32832	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MNS1	P32906	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YKL107W	P34251	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YPC1	P38298	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YBR242W	P38331	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	PAC2	P39937	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YFL051C	P43552	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	GWT1	P47026	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	DIE2	P50076	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	PHB2	P50085	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	TAF4	P50105	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	UFD1	P53044	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	TYW3	P53177	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	SCM3	Q12334	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	PRM4	Q12498	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	ODC2	Q99297	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MSI1	P13712	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MSN1	P22148	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YUH1	P35127	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	CPR5	P35176	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MIT1	P40002	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YND1	P40009	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	SWM2	P40342	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YIL060W	P40519	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
SCW4	YGR279C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	HEM25	Q07534	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	DGK1	Q12382	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	TRM13	Q12383	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MEC1	P38111	2368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
SCW4	YGR279C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	FLX1	P40464	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YKE4	P40544	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	CAT5	P41735	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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