RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C SSH1P38353 490 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YJR146WP47174 117 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C USE1P53146 245 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C CAB4P53332 305 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RRN5Q02983 363 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YPR098CQ06089 161 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SPO77Q06134 477 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SUE1Q06524 206 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MSH5Q12175 901 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SWI1P09547 1314 aa1.11□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SNF6P18888 332 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C CLB6P32943 380 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SGE1P33335 543 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C GOS1P38736 223 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C COG3P40094 801 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YJL016WP47072 561 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SNZ2P53824 298 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SPG4Q04438 115 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YDR124WQ04608 324 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RRS1Q08746 203 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C VPS68Q12016 184 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SGA1P08019 549 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SEC22P22214 214 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C FZO1P38297 855 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MRH4P53166 561 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SLM2P53955 656 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RSM10Q03201 203 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C GOT1Q03554 138 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C PAM18Q07914 168 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RRP40Q08285 240 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C CSM4Q08955 156 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YCT1Q12235 531 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MED4Q12343 284 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C EMP46Q12396 444 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C ATG31Q12421 196 aa1.1□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C TCP1P12612 559 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RCN1P36054 211 aa1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MRPL39P36533 70 aa1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YGP1P38616 354 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data1.09□□□□□ -2.23 RIP-Chip
HDA3YPR179C YHB1P39676 399 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C THO1P40040 218 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C TIF34P40217 347 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C JHD2P47156 728 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C MRPL50P53724 139 aa1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C RHO3Q00245 231 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C PEX12Q04370 399 aa1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C TY3A-GQ12173 290 aa1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C BBP1Q12365 385 aa1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C TY3A-IQ99219 290 aa1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C SAS5Q99314 248 aa1.09□□□□□ -2.23
HDA3YPR179C YER189WP40104 122 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C OST2P46964 130 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YJR079WP47126 109 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YOR186WQ08560 144 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C MSA2P36157 363 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C COS8P38723 381 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YHL026CP38740 315 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C FMC1P40491 155 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C MNN5P46982 586 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C HOC1P47124 396 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C COS6P53344 381 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C SRL4Q03085 281 aa1.08□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YLR462WO13556 202 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YEL075CP39972 122 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YNL046WP53956 172 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C PET117Q02771 107 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C KRE28Q04431 385 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C SCO1P23833 295 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C ERG24P32462 438 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C SCM4P32564 187 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C LDB7P38210 180 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YGL159WP53110 370 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C SEI1Q06058 285 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YLR030WQ07967 263 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YLR126CQ12288 251 aa1.07□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YHR032W-AP0C5N6 59 aa1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C CCA1P21269 546 aa1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YKL075CP36083 450 aa1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data1.06□□□□□ -2.24not detected
HDA3YPR179C SNX4P47057 423 aa1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C DAN1P47178 298 aa1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C FAR8Q05040 523 aa1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C EMC6Q12431 108 aa1.06□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C IPP1P00817 287 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C Q0255P03881 472 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C MATALPHA1P0CY06 175 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C HMLALPHA1P0CY07 175 aa1.05□□□□□ -2.24
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