RNA–Protein interactions for RNA: YML121W

GTR1, Transcript of Cytoplasmic GTPase, yeast

Gene GTR1, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR1	YML121W	YET3	Q07451	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	CKA2	P19454	339 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	DBF2	P22204	572 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	SRY1	P36007	326 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	FES1	P38260	290 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YIL012W	P40551	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	PDR17	P53844	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	MRX11	Q03079	207 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	MRX4	Q12467	430 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	COX5A	P00424	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	POP8	P38208	133 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	MIG3	P39943	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YER121W	P40076	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	COG3	P40094	801 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	SNO1	Q03144	224 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YNG1	Q08465	219 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	OM14	P38325	134 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	SHG1	P38337	142 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YJL016W	P47072	561 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	MRH4	P53166	561 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	AAH1	P53909	347 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YNL046W	P53956	172 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	PSK1	P31374	1356 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	MET2	P08465	486 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	ACP1	P32463	125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	CAF4	P36130	643 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	HMT1	P38074	348 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	AME1	P38313	324 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	GGC1	P38988	300 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YKE4	P40544	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	BXI1	P48558	297 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YNL140C	P53910	189 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	INP1	Q03694	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	LIP2	Q06005	328 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	HRT3	Q12347	344 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	TRM10	Q12400	293 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	QCR2	P07257	368 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	PUT1	P09368	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	GCN3	P14741	305 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	ERD2	P18414	219 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	TIP20	P33891	701 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YOX1	P34161	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	MRPL28	P36527	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	IGD1	P43598	195 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	GTR2	P53290	341 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GTR1	YML121W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
GTR1	YML121W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	OAC1	P32332	324 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	PHO89	P38361	574 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	KRE9	P39005	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	YJR056C	P47115	236 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	YLR460C	P54007	376 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	API2	Q04413	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	COS2	P0CX12	379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	COS3	P0CX13	379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	RRG9	P40156	214 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	COS4	P43542	379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	YGL034C	P53186	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	YGR018C	P53211	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	RTC4	P53850	401 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	NRK1	P53915	240 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	GOT1	Q03554	138 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	YML096W	Q04489	525 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	CPT1	P17898	393 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	ERG2	P32352	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	AVT6	P40074	448 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR1	YML121W	VHS1	Q03785	461 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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