RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	RHO2	P06781	192 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	HSP30	P25619	332 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	NUP2	P32499	720 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	UTR5	P32630	166 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	TOA1	P32773	286 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SPT10	P35208	640 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YER184C	P39961	794 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	GTR2	P53290	341 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	STD1	Q02794	444 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YPL039W	Q03080	316 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RAD30	Q04049	632 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	TAF11	Q04226	346 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SNO4	Q04902	237 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SML1	Q04964	104 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YPR098C	Q06089	161 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	IRC25	Q07951	179 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YPL199C	Q08954	240 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	HSP32	Q08992	237 aa		0.99	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YPK2	P18961	677 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	CTR86	P25355	563 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	AUA1	P32450	94 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	CLB6	P32943	380 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	NAT2	P37293	288 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YHR035W	P38769	630 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SLM1	P40485	686 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	MET28	P40573	187 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	AVT4	P50944	713 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	CAF40	P53829	373 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	VTI1	Q04338	217 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SRL2	Q12020	392 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	FCY22	Q12119	530 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	JLP1	Q12358	412 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YOL087C	Q99247	1116 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SGA1	P08019	549 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	MRPL17	P36528	281 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	GPI18	P38211	433 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RTC2	P38279	296 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	FIP1	P45976	327 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	PAC10	P48363	199 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	GPI1	P53306	609 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YNR064C	P53750	290 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	GOR1	P53839	350 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	HAL1	Q01766	294 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SCS7	Q03529	384 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SPC19	Q03954	165 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	UAF30	Q08747	228 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RPN6	Q12377	434 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	REP2	P03872	296 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SIR2	P06700	562 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	CCA1	P21269	546 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	MRPL25	P23369	157 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	POL4	P25615	582 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	MCM10	P32354	571 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	ECM25	P32525	599 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	BIG1	P38813	335 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	CIN4	P39110	191 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	COG3	P40094	801 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SIM1	P40472	476 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	BUD25	P85052	153 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	AEP3	Q12089	606 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RLM1	Q12224	676 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YLR126C	Q12288	251 aa		0.98	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	RHB1	P25378	209 aa		0.97	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SLC1	P33333	303 aa		0.97	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	HPM1	P40481	377 aa		0.97	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	CIN2	P46670	268 aa		0.97	□□□□□ -2.25
TTI1	YKL033W	YJL055W	P47044	245 aa		0.97	□□□□□ -2.25

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