RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 K7ENM7 598 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 TOM1L1O75674 476 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 BRD1O95696 1058 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 DSG1Q02413 1049 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 ZPBP2Q6X784 338 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 BICD1Q96G01 975 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 CHST7Q9NS84 486 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 PLXNA3P51805 1871 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAK2O60296 914 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF4AO95239 1232 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 USP41Q3LFD5 358 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 ACAP3Q96P50 834 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 CDH22Q9UJ99 828 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD39-201ENST00000393537 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SPTLC2O15270 562 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX28O15482 410 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 ADH1AP07327 375 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 CLCN4P51793 760 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 XKR4Q5GH76 650 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 CES5AQ6NT32 575 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 DYMQ7RTS9 669 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNN1Q92952 543 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SNX27Q96L92 541 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 PANK2Q9BZ23 570 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 TBX20Q9UMR3 447 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 CLDN3O15551 220 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 F13A1P00488 732 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 LIG4P49917 911 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 ITIH3Q06033 890 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SEZ6Q53EL9 994 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 KANK3Q6NY19 840 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXL18Q96ME1 805 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A087X0B3 334 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 WEE2P0C1S8 567 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SCP2P22307 547 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 STAT6P42226 847 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 CLCNKBP51801 687 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 MCL1Q07820 350 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 PKP1Q13835 747 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SV2BQ7L1I2 683 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX12PQ92771 950 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 FIZ1Q96SL8 496 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 VWA8A3KMH1 1905 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 MYMKA6NI61 221 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP6R2O75170 966 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 B3GAT3O94766 335 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 YEATS4O95619 227 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNE1P15382 129 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 RTP2Q5QGT7 225 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SFR1Q86XK3 245 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP57Q86XR8 500 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF135Q8IUD6 432 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR65Q8IYL9 337 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 PDILTQ8N807 584 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 UROC1Q96N76 676 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 CNTN3Q9P232 1028 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 MUC3AQ02505 3323 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 DCXO43602 365 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD39-201ENST00000393537 GLUD1P00367 558 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms