RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA SEC22P22214 214 aa1.72□□□□□ -2.13
15S_rRNA15S_rRNA YOR062CP36025 268 aa1.72□□□□□ -2.13
15S_rRNA15S_rRNA NRG2P38082 220 aa1.72□□□□□ -2.13
15S_rRNA15S_rRNA MRX3P38172 270 aa1.72□□□□□ -2.13
15S_rRNA15S_rRNA MRH4P53166 561 aa1.72□□□□□ -2.13
15S_rRNA15S_rRNA RSM10Q03201 203 aa1.72□□□□□ -2.13
15S_rRNA15S_rRNA YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
15S_rRNA15S_rRNA RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
15S_rRNA15S_rRNA FKS1P38631 1876 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA PRS4P38063 326 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA COS8P38723 381 aa1.71□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SMB1P40018 196 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA MEP1P40260 492 aa1.71□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YDR209CQ03480 137 aa1.71□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA KAP95Q06142 861 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA MSF1P08425 469 aa1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YKR104WP0CE69 306 aa1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA HOM6P31116 359 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA JEN1P36035 616 aa1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA RCN1P36054 211 aa1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA THO1P40040 218 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YER189WP40104 122 aa1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA GOT1Q03554 138 aa1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA DCR2Q05924 578 aa1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA COQ10Q08058 207 aa1.7□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA PUT1P09368 476 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA RNA15P25299 296 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YCR102CP25608 368 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA FZO1P38297 855 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YHB1P39676 399 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SNX4P47057 423 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YGL034CP53186 121 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA CTF19Q02732 369 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SDO1Q07953 250 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA CSM4Q08955 156 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA BTS1Q12051 335 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YLR462WO13556 202 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA EHD3P28817 500 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data1.69□□□□□ -2.14not detected
15S_rRNA15S_rRNA YEL075CP39972 122 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data1.69□□□□□ -2.14not detected
15S_rRNA15S_rRNA SNZ3P43545 298 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SPG4Q04438 115 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YPR098CQ06089 161 aa1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA RRP40Q08285 240 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA RSR1P13856 272 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA MRPL39P36533 70 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA BIG1P38813 335 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA GLG2P47011 380 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA USE1P53146 245 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA DAD3P69850 94 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YMR279CQ03263 540 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA FAR8Q05040 523 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA BBP1Q12365 385 aa1.68□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA GOS1P38736 223 aa1.67□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA FCY21P40039 528 aa1.67□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA MHT1Q12525 324 aa1.67□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA Q0255P03881 472 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SGE1P33335 543 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA BAT2P47176 376 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YGR026WP53217 278 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA PRM15Q03262 622 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YOR186WQ08560 144 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA RRS1Q08746 203 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YHR086W-AQ3E746 53 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA SWI1P09547 1314 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA DOA4P32571 926 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YBR096WP38256 230 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YHR125WP38831 101 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YCT1Q12235 531 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA YOL107WQ12239 342 aa1.66□□□□□ -2.14
15S_rRNA15S_rRNA ADH3P07246 375 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA YUH1P35127 236 aa1.65□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA RMR1P53060 241 aa1.65□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA SNZ2P53824 298 aa1.65□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA RHO3Q00245 231 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA AKR2Q12013 749 aa1.65□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA MSH5Q12175 901 aa1.65□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA COX5AP00424 153 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA ERG24P32462 438 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA DOG1P38774 246 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data1.64□□□□□ -2.15not detected
15S_rRNA15S_rRNA SMD3P43321 101 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA YGL159WP53110 370 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA GTR2P53290 341 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA INM2Q05533 292 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA YPR172WQ06608 200 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA YLR030WQ07967 263 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA RRT8Q08219 342 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA BOL1Q3E793 110 aa1.64□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA YHR032W-AP0C5N6 59 aa1.63□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA RPT5P33297 434 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA MSA2P36157 363 aa1.63□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data1.63□□□□□ -2.15not detected
15S_rRNA15S_rRNA YLR173WQ06247 608 aa1.63□□□□□ -2.15
15S_rRNA15S_rRNA INO80P53115 1489 aa1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 67.3 ms